117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3245 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3245  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  100 
 
 		 145 aa  295  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398056  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4073  thioesterase superfamily protein  42.19 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3837  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  42.11 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.488766 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3950  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  42.11 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0822744 
 
 
-
 
NC_003296  RS02013  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  44.53 
 
 		 136 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0821  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1329  thioesterase superfamily protein  38.64 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.866642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7163  thioesterase superfamily protein  40.46 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0500589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1512  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  39.86 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0277  putative 4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  40.31 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4467  thioesterase superfamily protein  37.59 
 
 		 150 aa  94.4  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192711 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0657  thioesterase superfamily protein  37.88 
 
 		 140 aa  94.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1590  thioesterase superfamily protein  39.39 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.228465  hitchhiker  0.00903187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1827  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  38.93 
 
 		 148 aa  90.1  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5092  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 139 aa  88.6  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.144651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0588  thioesterase superfamily protein  31.47 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2197  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021618  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3622  thioesterase superfamily protein  32.86 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.22745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2232  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2179  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2690  thioesterase superfamily protein  31.48 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3576  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6462  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0799  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.77 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3039  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.76 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1744  hypothetical protein  30 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0304185  normal  0.745927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1990  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0483278  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7090  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.94 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1888  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2827  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0777  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0740  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0509002  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3016  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.396701 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0777  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3115  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0270  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.23 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14220  4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  28.03 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126924  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0557  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.977538  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2192  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.947686  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  28.48 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0444  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.1 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0258  thioesterase  23.85 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024858  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1390  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2489  thioesterase superfamily protein  28.99 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2063  thioesterase-like  27.61 
 
 		 314 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.529459 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.23 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0397  thioesterase superfamily protein  27.08 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.995435  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4064  thioesterase superfamily protein  28.16 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000508078 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2312  thioesterase superfamily protein  24.24 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  27.47 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  24.74 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  24.81 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0924  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.55 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0795864 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 		 166 aa  47  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3458  thioesterase superfamily protein  26.8 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01931  thioesterase  25 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.976791  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0175  hypothetical protein  24.22 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.883072  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  26.9 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2943  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.1 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000565224  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0310  thioesterase superfamily protein  32.18 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.121979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3780  putative thioesterase  28.15 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  18.38 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01911  thioesterase  25 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27301  thioesterase  25.93 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  27.72 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2733  thioesterase superfamily protein  28.47 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2777  thioesterase superfamily protein  28.47 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2763  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205921  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1979  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105854  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  24.41 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  25.41 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.41 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1596  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51510  hypothetical protein  29.46 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000170599  hitchhiker  0.0000345324 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  25 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01606  hypothetical protein  23.21 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1541  hypothetical protein  26.88 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0674  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.712036 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003917  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.97 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0190272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1523  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.66 
 
 		 132 aa  42  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.010103  normal  0.859767 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4823  thioesterase superfamily protein  27.14 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1938  thioesterase superfamily protein  21.17 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.650407 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2184  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315338  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.73 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  25 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  26.62 
 
 		 164 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1444  thioesterase superfamily protein  20.16 
 
 		 129 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.084624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1849  thioesterase superfamily protein  23.33 
 
 		 138 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 149 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1875  thioesterase superfamily protein  23.33 
 
 		 138 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  26.62 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  26.62 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  27.46 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  26.62 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  26.62 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  26.62 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>