122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3622 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3622  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
146 aa  300  6.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.22745 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0588  thioesterase superfamily protein  75.86 
 
 
145 aa  228  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1329  thioesterase superfamily protein  36.17 
 
 
133 aa  96.7  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.866642  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1827  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  32.85 
 
 
148 aa  83.6  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115256  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4467  thioesterase superfamily protein  35.97 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.192711 
 
 
-
 
NC_003296  RS02013  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  34.07 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7163  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 
147 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0500589  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3245  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.86 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398056  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1512  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  30.88 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1590  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.228465  hitchhiker  0.00903187 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3837  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  31.43 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.488766 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3950  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  31.43 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0822744 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0277  putative 4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  31.39 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0821  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4073  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0657  thioesterase superfamily protein  32.12 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5092  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.144651  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2197  thioesterase superfamily protein  31.65 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021618  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0740  thioesterase superfamily protein  31.88 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0509002  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2179  thioesterase superfamily protein  31.65 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0777  thioesterase superfamily protein  31.88 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2232  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0777  thioesterase superfamily protein  31.16 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2808  thioesterase superfamily protein  34.55 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.511725  hitchhiker  0.00696789 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2690  thioesterase superfamily protein  32.97 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.01 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0444  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3016  thioesterase superfamily protein  26.24 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.396701 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14220  4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  29.27 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126924  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3100  thioesterase-like  27.97 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3576  thioesterase superfamily protein  26.44 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3780  putative thioesterase  27.34 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1990  thioesterase superfamily protein  24.21 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0483278  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7090  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.29 
 
 
139 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  27.06 
 
 
146 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3039  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.29 
 
 
138 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1888  thioesterase superfamily protein  23.48 
 
 
139 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.52 
 
 
131 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2192  thioesterase superfamily protein  26.95 
 
 
152 aa  50.1  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.947686  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  21.28 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0924  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.06 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0795864 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  24.24 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2489  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115223  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0969  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.43 
 
 
136 aa  48.9  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.475786  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  23.66 
 
 
136 aa  47.8  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3023  thioesterase superfamily protein  24.6 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2577  thioesterase superfamily protein  23.3 
 
 
192 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  22.63 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6462  thioesterase superfamily protein  26.06 
 
 
151 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 
133 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  24.42 
 
 
145 aa  47  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1390  thioesterase superfamily protein  30.85 
 
 
149 aa  47  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 
145 aa  47  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3386  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1260  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.6 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2763  thioesterase superfamily protein  24.6 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205921  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5014  thioesterase superfamily protein  23.88 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0270  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.86 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2733  thioesterase superfamily protein  24.6 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2777  thioesterase superfamily protein  24.6 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259185  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4765  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.36 
 
 
153 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3458  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
146 aa  45.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0557  thioesterase superfamily protein  26.44 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.977538  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5232  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.72 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200026  normal  0.202993 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2827  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0799  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.43 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117623  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  23.33 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27301  thioesterase  26 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5307  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.58 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  24.03 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.24 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3115  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
140 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0749  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.74 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  26.24 
 
 
143 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  21.14 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1413  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364047  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22071  hypothetical protein  26.03 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2063  thioesterase-like  25.55 
 
 
314 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.529459 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51510  hypothetical protein  28.79 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000170599  hitchhiker  0.0000345324 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  23.97 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2464  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.56 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2312  thioesterase superfamily protein  29.67 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36680  acyl-coenzyme A thioester hydrolase  24.22 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  22.13 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  23.44 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1860  hypothetical protein  23.81 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4208  thioesterase-like  22.54 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0607121  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2184  thioesterase superfamily protein  29.47 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315338  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03885  hypothetical protein  29.79 
 
 
157 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0605  thioesterase superfamily protein  20.63 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.646186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1860  thioesterase superfamily protein  25.22 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.484862  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0170  thioesterase superfamily protein  29.11 
 
 
133 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  19.78 
 
 
138 aa  41.6  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0310  thioesterase superfamily protein  24.49 
 
 
136 aa  41.6  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.121979  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.25 
 
 
149 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  21.88 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  21.88 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  23.96 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4340  thioesterase-like protein  22.54 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.408761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>