157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3950 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3950  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  100 
 
 		 143 aa  299  9e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0822744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3837  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  100 
 
 		 143 aa  299  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.488766 
 
 
-
 
NC_003296  RS02013  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  91.6 
 
 		 136 aa  258  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1512  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  54.14 
 
 		 152 aa  157  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1590  thioesterase superfamily protein  50.35 
 
 		 144 aa  150  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.228465  hitchhiker  0.00903187 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0277  putative 4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  49.64 
 
 		 147 aa  146  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7163  thioesterase superfamily protein  47.83 
 
 		 147 aa  144  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0500589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4073  thioesterase superfamily protein  51.54 
 
 		 147 aa  141  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0657  thioesterase superfamily protein  51.82 
 
 		 140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1827  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  51.88 
 
 		 148 aa  137  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0821  thioesterase superfamily protein  42.4 
 
 		 132 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3245  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.11 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398056  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2690  thioesterase superfamily protein  37.8 
 
 		 137 aa  100  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2232  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4467  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192711 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2179  thioesterase superfamily protein  33.82 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2197  thioesterase superfamily protein  36.3 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021618  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3622  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.22745 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0588  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5092  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.144651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1329  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.866642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0777  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0740  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0509002  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2192  thioesterase superfamily protein  29.33 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.947686  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0777  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1841  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.12 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00333557  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.69 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  29.71 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.37 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  26.12 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  28.06 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1990  thioesterase superfamily protein  25.58 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0483278  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3016  thioesterase superfamily protein  25.37 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.396701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 		 292 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3039  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.78 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.55 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14220  4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  28.8 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126924  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2382  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.98 
 
 		 289 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715533  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2489  thioesterase superfamily protein  29.5 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115223  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.56 
 
 		 285 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2733  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2777  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  26.28 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2735  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.6 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  24.62 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1888  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  26.87 
 
 		 287 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2763  thioesterase superfamily protein  28.87 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205921  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2027  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6462  thioesterase superfamily protein  26.45 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.19 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  23.26 
 
 		 161 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  23.26 
 
 		 164 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  23.26 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2312  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3023  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  27.94 
 
 		 289 aa  50.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  23.26 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  23.26 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  23.26 
 
 		 164 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  23.39 
 
 		 164 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2827  thioesterase superfamily protein  25.4 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1474  thioesterase superfamily protein  22.46 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291096  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.73 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2808  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.511725  hitchhiker  0.00696789 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2435  hypothetical protein  31.39 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1990  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 		 287 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1714  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 		 287 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  0.297354 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1773  putative thioesterase protein  23.91 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  29.67 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0605  thioesterase superfamily protein  23.93 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.646186  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  26.45 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7090  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.48 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1433  thioesterase superfamily protein  21.74 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  23.48 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  22.58 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  25 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2063  thioesterase-like  23.13 
 
 		 314 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.529459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0608  thioesterase superfamily protein  28.18 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0077  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.95 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  27.54 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3576  thioesterase superfamily protein  22.66 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0724  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.56 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.763036  normal  0.174534 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  23.48 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  20.61 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  23.31 
 
 		 288 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  26.4 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  29.21 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.4 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3893  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.39 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0698  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  23.26 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1744  hypothetical protein  32.22 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0304185  normal  0.745927 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  21.71 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0321  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.26 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>