75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0657 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0657  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 140 aa  291  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1827  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  69.57 
 
 		 148 aa  202  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1512  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  50.74 
 
 		 152 aa  147  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02013  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  55.3 
 
 		 136 aa  139  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3837  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  51.82 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.488766 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3950  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  51.82 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0822744 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1590  thioesterase superfamily protein  44.7 
 
 		 144 aa  114  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.228465  hitchhiker  0.00903187 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4073  thioesterase superfamily protein  41.48 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0277  putative 4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  40.88 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7163  thioesterase superfamily protein  40.15 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0500589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4467  thioesterase superfamily protein  39.69 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0821  thioesterase superfamily protein  40.91 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3245  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.88 
 
 		 145 aa  94.4  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398056  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2179  thioesterase superfamily protein  37.9 
 
 		 149 aa  93.6  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2197  thioesterase superfamily protein  34.88 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021618  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2690  thioesterase superfamily protein  37.01 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0588  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5092  thioesterase superfamily protein  34.92 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.144651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2232  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3622  thioesterase superfamily protein  32.12 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.22745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1329  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.866642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2192  thioesterase superfamily protein  26.71 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.947686  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92060  predicted protein  30.88 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.691769  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14220  4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  31.62 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126924  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2733  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2777  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3039  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.08 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3023  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2489  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115223  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2763  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205921  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7090  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.15 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  24 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6462  thioesterase superfamily protein  27.07 
 
 		 151 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3016  thioesterase superfamily protein  26.49 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.396701 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1990  thioesterase superfamily protein  30.85 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0483278  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3576  thioesterase superfamily protein  28.43 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2435  hypothetical protein  33.67 
 
 		 149 aa  50.1  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0777  thioesterase superfamily protein  22.73 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3302  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192522  normal  0.395393 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0740  thioesterase superfamily protein  25.84 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0509002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0777  thioesterase superfamily protein  25.84 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3458  thioesterase superfamily protein  24.09 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1888  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4124  hypothetical protein  22.05 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0674  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.712036 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 		 286 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4370  thioesterase superfamily protein  25.9 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.327633  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2808  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.511725  hitchhiker  0.00696789 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3100  thioesterase-like  28.24 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2116  hypothetical protein  31.18 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0532  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  22.58 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51510  hypothetical protein  27.34 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000170599  hitchhiker  0.0000345324 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 292 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51770  hypothetical protein  27.61 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185409 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.62 
 
 		 159 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2577  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 192 aa  41.6  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  23.74 
 
 		 136 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.98 
 
 		 159 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0605  thioesterase superfamily protein  21.99 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.646186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.63 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.92 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3780  putative thioesterase  22.46 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1474  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 		 149 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291096  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27301  thioesterase  29.35 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1744  hypothetical protein  25.84 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0304185  normal  0.745927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4540  hypothetical protein  27.61 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  24.24 
 
 		 147 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  26.47 
 
 		 130 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  24.24 
 
 		 147 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  24.24 
 
 		 147 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2189  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.94 
 
 		 148 aa  40  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  26.57 
 
 		 358 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>