107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6462 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6462  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14220  4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  36.36 
 
 
144 aa  84.3  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2827  thioesterase superfamily protein  29.5 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2312  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3576  thioesterase superfamily protein  31.65 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1990  thioesterase superfamily protein  30.94 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0483278  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7090  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.53 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3016  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.396701 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3039  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.46 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0270  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.58 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3115  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3245  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.14 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398056  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3458  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0799  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.6 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117623  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0170  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1888  thioesterase superfamily protein  30.22 
 
 
139 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1329  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.866642  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0444  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.76 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2489  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115223  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5092  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.144651  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2179  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7163  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0500589  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1512  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  29.58 
 
 
152 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2197  thioesterase superfamily protein  28.15 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021618  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4073  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0924  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  24.26 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0795864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3100  thioesterase-like  26.12 
 
 
152 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2812  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
152 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0277  putative 4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  29.93 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1590  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.228465  hitchhiker  0.00903187 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0277  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.1 
 
 
144 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3837  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  26.45 
 
 
143 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.488766 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3950  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  26.45 
 
 
143 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0822744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0821  thioesterase superfamily protein  23.36 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.73 
 
 
159 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4467  thioesterase superfamily protein  22.7 
 
 
150 aa  50.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.192711 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4370  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 
138 aa  50.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.327633  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0657  thioesterase superfamily protein  27.07 
 
 
140 aa  50.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2690  thioesterase superfamily protein  27.7 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1827  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  26.67 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115256  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  23.58 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3114  thioesterase superfamily protein  22.11 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144854  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  24.04 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2232  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2940  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  23.81 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0724  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  22.64 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.763036  normal  0.174534 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3622  thioesterase superfamily protein  26.06 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.22745 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02021  thioesterase  28.15 
 
 
150 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0211795  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2027  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.71 
 
 
141 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2228  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.32 
 
 
140 aa  47  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.159905  hitchhiker  0.000289051 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.36 
 
 
133 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  24.75 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1442  thioesterase superfamily protein  26.71 
 
 
152 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.444446  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.46 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.78 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02013  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  24.82 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.43 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  25.19 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0557  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.977538  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  21.97 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4823  thioesterase superfamily protein  28.87 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2993  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.13 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.695823  normal  0.0154656 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4124  hypothetical protein  25.19 
 
 
161 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158038  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2921  thioesterase superfamily protein  24.47 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  25.56 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.74 
 
 
159 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  34.72 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  21.74 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0588  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  23.88 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1106  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.54 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.157487 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2889  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.92 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.992552  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3175  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.43 
 
 
154 aa  43.5  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0740  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0509002  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0674  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.712036 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  26.81 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1841  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.78 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00333557  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  22.54 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0777  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1474  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291096  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4902  thioesterase-like  22.22 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1090  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.46 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2583  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  23.85 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412087  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.61 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  21.74 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  21.74 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1924  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.06 
 
 
191 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 
139 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0777  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
137 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0397  thioesterase superfamily protein  25.62 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.995435  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0681  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  23.29 
 
 
164 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  23.29 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  22.96 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1529  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  19 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.624218  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  23.29 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  23.29 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  22.96 
 
 
164 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>