136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3916 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  100 
 
 		 143 aa  291  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0444  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  58.52 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3115  thioesterase superfamily protein  53.57 
 
 		 140 aa  164  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0270  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  51.82 
 
 		 138 aa  158  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0799  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  49.28 
 
 		 139 aa  152  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2489  thioesterase superfamily protein  44.93 
 
 		 139 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115223  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14220  4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  36.64 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2312  thioesterase superfamily protein  37.01 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3016  thioesterase superfamily protein  35.2 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.396701 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0170  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1888  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1990  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0483278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3039  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.28 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7090  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.92 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3576  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2827  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02013  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  30.47 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3458  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6462  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3950  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  29.69 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0822744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3837  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  29.69 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.488766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0588  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0969  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.8 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.475786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3622  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.22745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2232  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  29.9 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  27.62 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0777  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3245  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.23 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398056  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0740  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0509002  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0777  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  30.21 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  30.21 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1329  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.866642  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1224  thioesterase family protein  27.78 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0347226  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004071  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  26.96 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1293  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.15 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2096  putative thioesterase  27.78 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2179  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  28.87 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.17 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  25.38 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1938  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.650407 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2184  thioesterase superfamily protein  28.71 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315338  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  24.47 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  25.89 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4073  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2690  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1590  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.228465  hitchhiker  0.00903187 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1462  thioesterase superfamily protein  22.58 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000224992  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.14 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2940  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.68 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  25.56 
 
 		 287 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4799  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.77 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.974363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2384  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.35 
 
 		 204 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29549  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4268  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.47 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03885  hypothetical protein  24.64 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1483  thioesterase superfamily protein  27.62 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203632  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  25.78 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2049  thioesterase superfamily protein  27.06 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4124  hypothetical protein  27.61 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0821  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0605  thioesterase superfamily protein  24.24 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.646186  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  24.21 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0841  thioesterase superfamily protein  25.96 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2723  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.71 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1529  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.75 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.624218  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.9 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4165  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.28 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01911  thioesterase  24.59 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1106  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.07 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.157487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4018  thioesterase superfamily protein  27.55 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1013  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.17 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505536  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  25.56 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.61 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4575  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4467  thioesterase superfamily protein  30.11 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192711 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  24.51 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0343  thioesterase superfamily protein  23.46 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3683  thioesterase superfamily protein  23.46 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  33.78 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  24.51 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2192  thioesterase superfamily protein  28.15 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.947686  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5092  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.144651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0439  thioesterase superfamily protein  23.46 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3916  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0924  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.28 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0795864 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  26.56 
 
 		 160 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0335  thioesterase superfamily protein  23.46 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0333  thioesterase superfamily protein  23.46 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0343  thioesterase superfamily protein  23.46 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0418657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1512  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  26.98 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  26.81 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1924  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.2 
 
 		 191 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.81 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0175  hypothetical protein  25.25 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.883072  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25 
 
 		 285 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  24 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>