More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1423 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  100 
 
 
136 aa  282  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1260  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.36 
 
 
138 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1462  thioesterase superfamily protein  41.54 
 
 
141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000224992  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1596  thioesterase superfamily protein  36.76 
 
 
149 aa  106  9.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186946 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 
138 aa  106  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  46.09 
 
 
133 aa  104  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1267  thioesterase superfamily protein  41.03 
 
 
139 aa  99  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000790915  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2255  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 
139 aa  97.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00034337  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  33.86 
 
 
155 aa  96.7  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3714  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.86 
 
 
139 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0608  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1601  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.65 
 
 
139 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000385666  hitchhiker  0.0000353735 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3626  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  33.86 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00511508  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3632  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.86 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3401  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.86 
 
 
139 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3363  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.86 
 
 
139 aa  94.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3617  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.86 
 
 
139 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000115588 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3667  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.86 
 
 
139 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3313  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.07 
 
 
139 aa  94  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000159774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  38.53 
 
 
149 aa  93.6  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.93 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  39.47 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 
138 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  34.03 
 
 
146 aa  91.3  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 
146 aa  89.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1211  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 
153 aa  89.4  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  37.7 
 
 
138 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  41.59 
 
 
145 aa  89  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0833  thioesterase superfamily protein  34.88 
 
 
137 aa  89  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  33.33 
 
 
155 aa  87.4  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.83 
 
 
138 aa  87  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0132  thioesterase superfamily protein  38.1 
 
 
149 aa  86.7  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00894639  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2119  thioesterase  36.36 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.06428  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  36.76 
 
 
135 aa  84.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1860  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
149 aa  83.6  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.484862  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5014  thioesterase superfamily protein  35.07 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  34.4 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  34.4 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0605  thioesterase superfamily protein  35.19 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.646186  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0672  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  38.26 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.53 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
140 aa  80.1  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4018  thioesterase superfamily protein  36.28 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  34.91 
 
 
136 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2098  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.206892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4317  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2184  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315338  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1492  putative thioesterase  38.39 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299251  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3386  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1993  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2936  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.535343  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0597  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0896  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155236  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2735  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.48 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  38.61 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2329  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.383331 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03885  hypothetical protein  35.78 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1094  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
149 aa  73.6  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  36.27 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3609  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.7 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1575  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.242963 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3892  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0697  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1444  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.084624  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2049  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.67 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.29 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0973  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.192088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4575  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3057  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0408994  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4807  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.777198  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0934  hypothetical protein  25.93 
 
 
143 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3386  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.5 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.09 
 
 
133 aa  62  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1692  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.662828  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.93 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00778  hypothetical protein  27.87 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.36 
 
 
133 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3691  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.36122 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4768  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283541  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10971  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  31.97 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.984698  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3895  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.13 
 
 
149 aa  61.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0343  thioesterase superfamily protein  25.23 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3683  thioesterase superfamily protein  25.23 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0841  thioesterase superfamily protein  37.17 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0340  thioesterase superfamily protein  25.83 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4384  protein with predicted thioesterase domain-containing protein  29.25 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00746999  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  29.41 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0333  thioesterase superfamily protein  25.83 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0439  thioesterase superfamily protein  25.83 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0335  thioesterase superfamily protein  25.83 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0343  thioesterase superfamily protein  25.83 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0418657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>