153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4467 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4467  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
150 aa  309  7.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.192711 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2197  thioesterase superfamily protein  44.93 
 
 
139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021618  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2179  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 
149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0821  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 
132 aa  110  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1512  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  43.7 
 
 
152 aa  107  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7163  thioesterase superfamily protein  36.24 
 
 
147 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0500589  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0277  putative 4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  35.57 
 
 
147 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5092  thioesterase superfamily protein  37.41 
 
 
139 aa  104  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.144651  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2232  thioesterase superfamily protein  39.69 
 
 
134 aa  102  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0657  thioesterase superfamily protein  39.69 
 
 
140 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02013  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  35.56 
 
 
136 aa  100  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1590  thioesterase superfamily protein  37.68 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.228465  hitchhiker  0.00903187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1827  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  39.68 
 
 
148 aa  97.4  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115256  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3837  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  35.11 
 
 
143 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.488766 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3950  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  35.11 
 
 
143 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0822744 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4073  thioesterase superfamily protein  36.76 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3245  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.59 
 
 
145 aa  94.4  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398056  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1329  thioesterase superfamily protein  42.97 
 
 
133 aa  92  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.866642  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2690  thioesterase superfamily protein  38.71 
 
 
137 aa  89.4  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0588  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
145 aa  84  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3622  thioesterase superfamily protein  35.97 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.22745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2943  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.01 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000565224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2192  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.947686  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.85 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0777  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0532  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.5 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0740  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0509002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0777  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3576  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3016  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.396701 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3039  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2063  thioesterase-like  26.62 
 
 
314 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.529459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1990  thioesterase superfamily protein  34.12 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0483278  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3458  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  25.98 
 
 
133 aa  53.9  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 
128 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1224  thioesterase family protein  28.89 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0347226  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02688  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.23 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000607478  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.34 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14220  4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  29.13 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51510  hypothetical protein  28.46 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000170599  hitchhiker  0.0000345324 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92060  predicted protein  30.47 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.691769  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3086  thioesterase family protein  28.46 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3228  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 
141 aa  50.4  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6462  thioesterase superfamily protein  22.7 
 
 
151 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0674  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 
143 aa  50.1  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.712036 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.24 
 
 
159 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.23 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  26.4 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.4 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7090  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.36 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3047  hypothetical protein  28.46 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1888  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.23 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  34.18 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2312  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  24.63 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0494  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4370  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 
138 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.327633  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.159838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0557  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638936  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0496  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0258  thioesterase  23.81 
 
 
141 aa  47  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024858  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.24 
 
 
145 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  28 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2827  thioesterase superfamily protein  28.37 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0724  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.61 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.763036  normal  0.174534 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 
132 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.4 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0270  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.18 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.87 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3123  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.95 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.2 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3893  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.97 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2189  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.22 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.98 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  27.34 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  26.87 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.11 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3780  putative thioesterase  26.81 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  27.12 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
134 aa  44.3  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2027  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.53 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0170  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3570  thioesterase superfamily protein  31.51 
 
 
132 aa  44.3  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0799  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.38 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117623  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  24.24 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1773  putative thioesterase protein  27.13 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.19 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4057  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.31 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  23.36 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2489  thioesterase superfamily protein  26.81 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115223  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00399  hypothetical protein  24.62 
 
 
132 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3189  thioesterase superfamily protein  24.62 
 
 
132 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590912  normal  0.0179744 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>