More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2312 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2312  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
142 aa  296  6e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3039  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  57.78 
 
 
138 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2827  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 
149 aa  124  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3016  thioesterase superfamily protein  35.82 
 
 
138 aa  91.3  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.396701 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0799  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.66 
 
 
139 aa  90.1  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117623  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0444  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.47 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0270  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.72 
 
 
138 aa  89  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3115  thioesterase superfamily protein  34.35 
 
 
140 aa  87  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0170  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
133 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.01 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7090  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.28 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14220  4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  35.11 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126924  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1990  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0483278  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6462  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3576  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2489  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115223  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1888  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3458  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.98 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4370  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.327633  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.08 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  26 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36680  acyl-coenzyme A thioester hydrolase  30 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.96 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3114  thioesterase superfamily protein  30.82 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144854  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1224  thioesterase family protein  30.47 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0347226  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.91 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.46 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  22.22 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1938  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.650407 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.16 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.16 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.34 
 
 
129 aa  60.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  30.77 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0740  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0509002  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4200  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.53 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367475  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51770  hypothetical protein  30.51 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185409 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1218  hypothetical protein  30.53 
 
 
150 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339856  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.77 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4406  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.71 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0255254  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1013  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.81 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505536  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0608  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1247  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.53 
 
 
150 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  27.56 
 
 
132 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  23.33 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1529  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.41 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.624218  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0777  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
137 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.56 
 
 
132 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  30.47 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4540  hypothetical protein  30.51 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.53 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2953  putative thioesterase protein  29.03 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0150824  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1273  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.93 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.03 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2098  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.206892 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0777  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  30.77 
 
 
130 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1492  putative thioesterase  29.51 
 
 
134 aa  57  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299251  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2940  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30 
 
 
145 aa  57  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2808  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.511725  hitchhiker  0.00696789 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0155  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3997  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.99 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.666415  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1267  thioesterase superfamily protein  25.24 
 
 
139 aa  57  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000790915  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2192  thioesterase superfamily protein  33.68 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.947686  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2921  thioesterase superfamily protein  25.55 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2228  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.66 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.159905  hitchhiker  0.000289051 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.27 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0397  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.995435  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.2 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3100  thioesterase-like  31.96 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5092  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.144651  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2889  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.97 
 
 
158 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.992552  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0562  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.93 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  22.34 
 
 
146 aa  54.3  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  24.8 
 
 
148 aa  54.7  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1215  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.98 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  29.01 
 
 
137 aa  54.7  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01931  thioesterase  25.71 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.976791  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 
144 aa  53.9  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0724  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.27 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.763036  normal  0.174534 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.72 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2542  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.59 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000475401  hitchhiker  0.00000263931 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0969  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.2 
 
 
136 aa  53.5  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.475786  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4165  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.85 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161353  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1781  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.59 
 
 
133 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000346998  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1742  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.59 
 
 
133 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000282054  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1738  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.59 
 
 
133 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000578703  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.58 
 
 
159 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2583  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.51 
 
 
141 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412087  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02013  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  27.91 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2723  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.72 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>