121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3115 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3115  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
140 aa  291  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0799  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  74.64 
 
 
139 aa  230  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117623  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0270  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  73.91 
 
 
138 aa  224  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  53.57 
 
 
143 aa  164  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2489  thioesterase superfamily protein  47.1 
 
 
139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115223  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0444  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  47.1 
 
 
140 aa  149  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1990  thioesterase superfamily protein  34.33 
 
 
139 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0483278  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7090  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.62 
 
 
139 aa  97.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3039  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.88 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1888  thioesterase superfamily protein  32.82 
 
 
139 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3576  thioesterase superfamily protein  32.82 
 
 
139 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2312  thioesterase superfamily protein  34.35 
 
 
142 aa  87  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2827  thioesterase superfamily protein  37.59 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14220  4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  32.06 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126924  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0170  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 
133 aa  81.6  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6462  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3016  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.396701 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 
145 aa  66.6  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3245  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.46 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398056  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0969  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.44 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.475786  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4018  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 
133 aa  54.3  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 
146 aa  53.5  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1224  thioesterase family protein  25.58 
 
 
143 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0347226  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4073  thioesterase superfamily protein  26.87 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  24.24 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  29.13 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1329  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.866642  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.13 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2184  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315338  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0588  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.78 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2232  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1462  thioesterase superfamily protein  27.85 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000224992  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1107  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.27 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0129163  normal  0.667766 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3458  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 
146 aa  47.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2690  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 
137 aa  47.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7163  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0500589  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.98 
 
 
133 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0672  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0277  putative 4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  30.77 
 
 
147 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  24.6 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0431  thioesterase superfamily protein  28.07 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  25.56 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  24.07 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  23.48 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  24.07 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5092  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.144651  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2940  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.22 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1483  thioesterase superfamily protein  27.07 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203632  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5100  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  27.12 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1013  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.37 
 
 
154 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505536  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2197  thioesterase superfamily protein  32.05 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021618  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.83 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4375  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.22 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.36 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1494  thioesterase superfamily protein  25.88 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  21.8 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4603  thioesterase superfamily protein  23.53 
 
 
154 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0332  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.64 
 
 
159 aa  44.3  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  27.52 
 
 
144 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3622  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.22745 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3691  thioesterase superfamily protein  24.56 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.36122 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4768  thioesterase superfamily protein  24.56 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283541  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.09 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  22.31 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51770  hypothetical protein  25.9 
 
 
148 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185409 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.15 
 
 
140 aa  43.5  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  23.81 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2179  thioesterase superfamily protein  24.22 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.14 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1238  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.106775  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1849  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.19 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124156  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.69 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2228  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.58 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.159905  hitchhiker  0.000289051 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2953  putative thioesterase protein  26.42 
 
 
141 aa  42.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0150824  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0432  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17123  normal  0.284958 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2063  thioesterase-like  27.48 
 
 
314 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.529459 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  22.3 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2921  thioesterase superfamily protein  26.28 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01931  thioesterase  26.52 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.976791  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0318  thioesterase superfamily protein  21.24 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109584 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0833  thioesterase superfamily protein  20 
 
 
137 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0343  thioesterase superfamily protein  20 
 
 
144 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3683  thioesterase superfamily protein  20 
 
 
144 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0821  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 
132 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4540  hypothetical protein  25.9 
 
 
148 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0557  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
129 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.977538  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  23.39 
 
 
150 aa  41.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4799  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.79 
 
 
148 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.974363  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3386  thioesterase superfamily protein  24.6 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01911  thioesterase  24.43 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.3 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0605  thioesterase superfamily protein  21.97 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.646186  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0335  thioesterase superfamily protein  18.75 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0439  thioesterase superfamily protein  18.75 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2096  putative thioesterase  19.77 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>