143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0432 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0432  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
141 aa  292  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17123  normal  0.284958 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0431  thioesterase superfamily protein  82.14 
 
 
149 aa  243  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5100  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  82.14 
 
 
141 aa  242  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3386  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  51.47 
 
 
143 aa  176  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0340  thioesterase superfamily protein  50.74 
 
 
143 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0343  thioesterase superfamily protein  50.74 
 
 
143 aa  169  9e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0418657 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0335  thioesterase superfamily protein  50.74 
 
 
143 aa  169  9e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0333  thioesterase superfamily protein  50.74 
 
 
143 aa  169  9e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0439  thioesterase superfamily protein  50.74 
 
 
144 aa  169  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0343  thioesterase superfamily protein  49.26 
 
 
144 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3683  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
144 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3518  thioesterase superfamily protein  51.47 
 
 
144 aa  165  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4375  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  50.74 
 
 
144 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0334  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  48.53 
 
 
144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0345  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.59 
 
 
143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3895  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  47.06 
 
 
149 aa  161  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0318  thioesterase superfamily protein  44.29 
 
 
159 aa  155  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4603  thioesterase superfamily protein  49.24 
 
 
154 aa  155  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3880  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  51.94 
 
 
135 aa  155  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00778  hypothetical protein  51.52 
 
 
144 aa  150  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0697  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
143 aa  150  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0119  thioesterase  50.41 
 
 
147 aa  149  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000833529  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0934  hypothetical protein  48.91 
 
 
143 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3057  thioesterase superfamily protein  48.18 
 
 
143 aa  146  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0408994  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4080  thioesterase superfamily protein  52.31 
 
 
142 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.339486  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3916  thioesterase superfamily protein  56.03 
 
 
143 aa  144  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445729  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4384  protein with predicted thioesterase domain-containing protein  49.61 
 
 
138 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00746999  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3605  thioesterase superfamily protein  50.77 
 
 
142 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3691  thioesterase superfamily protein  47.45 
 
 
144 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.36122 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4768  thioesterase superfamily protein  47.45 
 
 
144 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283541  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1494  thioesterase superfamily protein  45.59 
 
 
139 aa  139  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0896  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155236  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2096  putative thioesterase  46.21 
 
 
152 aa  137  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3892  thioesterase superfamily protein  48.85 
 
 
140 aa  136  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4807  thioesterase superfamily protein  48.85 
 
 
140 aa  135  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.777198  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004071  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  43.94 
 
 
148 aa  133  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0973  thioesterase superfamily protein  42.19 
 
 
150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.192088  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0284  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  45.53 
 
 
144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000478521  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4575  thioesterase superfamily protein  44.8 
 
 
140 aa  123  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0434  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 
146 aa  99.4  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1860  thioesterase superfamily protein  35.94 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.484862  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1692  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.662828  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2119  thioesterase  34.71 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.06428  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3609  thioesterase superfamily protein  44.74 
 
 
172 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1993  thioesterase superfamily protein  25.38 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2196  thioesterase superfamily protein  39.47 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1694  thioesterase  37.84 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2654  thioesterase  33.6 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0239  hypothetical protein  43.06 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0185294  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 
145 aa  63.5  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04081  thioesterase  36 
 
 
146 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.764654 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  28.21 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0132  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00894639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0597  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4077  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  26.5 
 
 
146 aa  57.8  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 
134 aa  57  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  29.57 
 
 
155 aa  57  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  29.57 
 
 
155 aa  57  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2255  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
139 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00034337  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  34.67 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1260  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.62 
 
 
138 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4018  thioesterase superfamily protein  31.76 
 
 
133 aa  54.3  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3626  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  32 
 
 
139 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00511508  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  32.47 
 
 
136 aa  53.9  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3632  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32 
 
 
139 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3714  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32 
 
 
139 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  37 
 
 
134 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3401  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3363  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3313  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000159774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3667  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1601  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000385666  hitchhiker  0.0000353735 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  26.56 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3617  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000115588 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1149  thioesterase superfamily protein  31 
 
 
163 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.13 
 
 
149 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1179  thioesterase superfamily protein  31 
 
 
163 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2049  thioesterase superfamily protein  28.43 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2577  thioesterase superfamily protein  35.44 
 
 
192 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.99 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0701  hypothetical protein  35.53 
 
 
153 aa  50.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00299166  normal  0.252492 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3139  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.67 
 
 
166 aa  50.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10971  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  22.41 
 
 
137 aa  50.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.984698  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  27.68 
 
 
149 aa  50.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5014  thioesterase superfamily protein  27.84 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1575  thioesterase superfamily protein  37.31 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.242963 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.82 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1094  thioesterase superfamily protein  22.48 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.89 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.38 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1596  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186946 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>