262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0896 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0896  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
142 aa  298  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155236  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3892  thioesterase superfamily protein  67.67 
 
 
140 aa  203  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4807  thioesterase superfamily protein  65.44 
 
 
140 aa  202  9e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.777198  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4575  thioesterase superfamily protein  62.5 
 
 
140 aa  188  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0439  thioesterase superfamily protein  53.85 
 
 
144 aa  167  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0343  thioesterase superfamily protein  53.85 
 
 
143 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0418657 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0333  thioesterase superfamily protein  53.85 
 
 
143 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0335  thioesterase superfamily protein  53.85 
 
 
143 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4375  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  54.62 
 
 
144 aa  166  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0334  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  53.85 
 
 
144 aa  166  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3895  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  54.76 
 
 
149 aa  165  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0343  thioesterase superfamily protein  53.85 
 
 
144 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3683  thioesterase superfamily protein  54.62 
 
 
144 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0340  thioesterase superfamily protein  53.08 
 
 
143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0318  thioesterase superfamily protein  49.64 
 
 
159 aa  164  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4603  thioesterase superfamily protein  53.08 
 
 
154 aa  164  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3518  thioesterase superfamily protein  51.54 
 
 
144 aa  164  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0934  hypothetical protein  54.2 
 
 
143 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0697  thioesterase superfamily protein  53.38 
 
 
143 aa  160  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00778  hypothetical protein  54.89 
 
 
144 aa  159  9e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3057  thioesterase superfamily protein  52.67 
 
 
143 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0408994  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4768  thioesterase superfamily protein  49.65 
 
 
144 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283541  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3916  thioesterase superfamily protein  57.14 
 
 
143 aa  155  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445729  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3691  thioesterase superfamily protein  49.65 
 
 
144 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.36122 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3386  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  54.55 
 
 
143 aa  154  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0345  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  50.79 
 
 
143 aa  152  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4384  protein with predicted thioesterase domain-containing protein  55.64 
 
 
138 aa  150  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00746999  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004071  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  50.39 
 
 
148 aa  149  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4080  thioesterase superfamily protein  45.99 
 
 
142 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.339486  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3605  thioesterase superfamily protein  45.26 
 
 
142 aa  146  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2096  putative thioesterase  49.24 
 
 
152 aa  146  8e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5100  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  49.62 
 
 
141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0431  thioesterase superfamily protein  48.12 
 
 
149 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3880  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  48.84 
 
 
135 aa  142  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0432  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17123  normal  0.284958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1494  thioesterase superfamily protein  44.96 
 
 
139 aa  134  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0119  thioesterase  43.55 
 
 
147 aa  114  5e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000833529  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0434  thioesterase superfamily protein  37.6 
 
 
146 aa  102  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0973  thioesterase superfamily protein  35.97 
 
 
150 aa  100  5e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.192088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1993  thioesterase superfamily protein  37.9 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0284  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  36.44 
 
 
144 aa  93.6  9e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000478521  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  34.23 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  35.07 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  33.33 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1692  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.662828  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0916  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4018  thioesterase superfamily protein  35.23 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1094  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5014  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1860  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.484862  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 
138 aa  70.1  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1492  putative thioesterase  30.89 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299251  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  31.53 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3386  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  31.53 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  27.68 
 
 
138 aa  67  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2654  thioesterase  33.33 
 
 
149 aa  67  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3609  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0833  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  26.45 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1462  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000224992  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0597  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.76 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2329  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.383331 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0608  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 
135 aa  63.5  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.67 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 
128 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.45 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2119  thioesterase  29.84 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.06428  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0132  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00894639  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1444  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.084624  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0239  hypothetical protein  30.6 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0185294  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2049  thioesterase superfamily protein  27.93 
 
 
138 aa  60.5  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2196  thioesterase superfamily protein  32.65 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  29.73 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03885  hypothetical protein  30.7 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0672  thioesterase superfamily protein  25.89 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  30.56 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1260  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.12 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  28.04 
 
 
155 aa  58.9  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2255  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00034337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1601  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.04 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000385666  hitchhiker  0.0000353735 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3313  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.04 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000159774  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3714  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.04 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3401  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.04 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3363  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.04 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3667  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.04 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3617  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.04 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000115588 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1523  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.03 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.010103  normal  0.859767 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1596  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 
149 aa  57  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186946 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0841  thioesterase superfamily protein  40.32 
 
 
131 aa  56.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2936  thioesterase superfamily protein  34.33 
 
 
131 aa  56.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.535343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>