162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2654 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2654  thioesterase  100 
 
 
149 aa  312  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0916  thioesterase superfamily protein  40.94 
 
 
161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2119  thioesterase  44.93 
 
 
138 aa  114  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.06428  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1094  thioesterase superfamily protein  41.22 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03885  hypothetical protein  38.24 
 
 
157 aa  98.2  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1860  thioesterase superfamily protein  39.23 
 
 
149 aa  97.1  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.484862  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0132  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00894639  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1993  thioesterase superfamily protein  30.66 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0431  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0318  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109584 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4575  thioesterase superfamily protein  38.28 
 
 
140 aa  72  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4384  protein with predicted thioesterase domain-containing protein  36.75 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00746999  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5100  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  34.71 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  26.15 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1692  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.662828  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4375  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.71 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3916  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445729  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0343  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3605  thioesterase superfamily protein  35.17 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0934  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3683  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3386  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.82 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4080  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.339486  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3057  thioesterase superfamily protein  34.56 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0408994  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3895  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.45 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3518  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10971  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  26.56 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.984698  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0439  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0896  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
142 aa  67  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155236  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0335  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0333  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0343  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0418657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3880  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  33.33 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4807  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.777198  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  28.44 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  28.44 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4603  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0345  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.13 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0334  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.35 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0432  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17123  normal  0.284958 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1494  thioesterase superfamily protein  34.91 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  27.62 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11031  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  27.55 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.212306  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11021  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  28.57 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0792873  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0340  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00778  hypothetical protein  34.21 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3892  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  28.18 
 
 
133 aa  63.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0697  thioesterase superfamily protein  31.39 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3691  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.36122 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4768  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283541  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0833  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
137 aa  60.5  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1596  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 
149 aa  60.5  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186946 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004071  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  27.54 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2096  putative thioesterase  28.76 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0284  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  26.55 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000478521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1575  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 
162 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.242963 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  28.44 
 
 
155 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0474  hypothetical protein  32 
 
 
134 aa  57.8  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.637818  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1023  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  28.57 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00412471  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4502  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.07 
 
 
161 aa  57  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0701  hypothetical protein  27.78 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00299166  normal  0.252492 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3609  thioesterase superfamily protein  28.18 
 
 
172 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3139  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.67 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1860  hypothetical protein  24.62 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0608  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2184  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315338  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2196  thioesterase superfamily protein  28.04 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3386  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 
140 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2255  thioesterase superfamily protein  23.85 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00034337  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  25.45 
 
 
155 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3626  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  23.31 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00511508  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  26.23 
 
 
135 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1601  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.23 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000385666  hitchhiker  0.0000353735 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3632  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.31 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3313  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.31 
 
 
139 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000159774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 
140 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0597  thioesterase superfamily protein  23.58 
 
 
142 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0973  thioesterase superfamily protein  27.43 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.192088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3401  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.31 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3363  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.31 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251262  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0672  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3667  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.31 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.69 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3714  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.45 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0119  thioesterase  31.25 
 
 
147 aa  52.8  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000833529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3617  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.31 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000115588 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0239  hypothetical protein  29.09 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0185294  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  26.28 
 
 
146 aa  52  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  25.89 
 
 
149 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04081  thioesterase  24.72 
 
 
146 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.764654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 
137 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1444  thioesterase superfamily protein  22.52 
 
 
129 aa  51.2  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.084624  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>