243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3057 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3057  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
143 aa  300  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0408994  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0934  hypothetical protein  96.5 
 
 
143 aa  293  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0697  thioesterase superfamily protein  85.31 
 
 
143 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00778  hypothetical protein  82.61 
 
 
144 aa  244  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4768  thioesterase superfamily protein  79.41 
 
 
144 aa  233  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283541  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3691  thioesterase superfamily protein  79.41 
 
 
144 aa  233  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.36122 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3605  thioesterase superfamily protein  70.42 
 
 
142 aa  216  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4080  thioesterase superfamily protein  69.01 
 
 
142 aa  213  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.339486  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4384  protein with predicted thioesterase domain-containing protein  57.58 
 
 
138 aa  170  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00746999  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0334  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  53.24 
 
 
144 aa  168  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0333  thioesterase superfamily protein  53.24 
 
 
143 aa  168  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0343  thioesterase superfamily protein  53.24 
 
 
143 aa  168  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0418657 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0335  thioesterase superfamily protein  53.24 
 
 
143 aa  168  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0340  thioesterase superfamily protein  53.24 
 
 
143 aa  168  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0439  thioesterase superfamily protein  53.24 
 
 
144 aa  167  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4375  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  53.24 
 
 
144 aa  167  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0343  thioesterase superfamily protein  52.52 
 
 
144 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3683  thioesterase superfamily protein  53.24 
 
 
144 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4807  thioesterase superfamily protein  54.62 
 
 
140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.777198  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3386  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  53.38 
 
 
143 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0896  thioesterase superfamily protein  52.67 
 
 
142 aa  159  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155236  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0318  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 
159 aa  159  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3895  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  53.38 
 
 
149 aa  157  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3892  thioesterase superfamily protein  53.08 
 
 
140 aa  157  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4575  thioesterase superfamily protein  53.85 
 
 
140 aa  155  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4603  thioesterase superfamily protein  50.38 
 
 
154 aa  153  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3916  thioesterase superfamily protein  56.67 
 
 
143 aa  152  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445729  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0345  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  54.92 
 
 
143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3880  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  49.62 
 
 
135 aa  150  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3518  thioesterase superfamily protein  48.87 
 
 
144 aa  149  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0432  thioesterase superfamily protein  48.18 
 
 
141 aa  146  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17123  normal  0.284958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1494  thioesterase superfamily protein  48.12 
 
 
139 aa  146  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5100  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  47.79 
 
 
141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0431  thioesterase superfamily protein  47.06 
 
 
149 aa  144  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0119  thioesterase  50.86 
 
 
147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000833529  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004071  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  44.7 
 
 
148 aa  128  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2096  putative thioesterase  41.35 
 
 
152 aa  120  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0973  thioesterase superfamily protein  39.42 
 
 
150 aa  114  6e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.192088  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0434  thioesterase superfamily protein  33.57 
 
 
146 aa  97.8  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1993  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
137 aa  95.9  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0284  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  37.4 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000478521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1692  thioesterase superfamily protein  36.15 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.662828  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1860  thioesterase superfamily protein  32.82 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.484862  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3609  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  34.91 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.6 
 
 
149 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0239  hypothetical protein  33.86 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0185294  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5014  thioesterase superfamily protein  36.78 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2329  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.383331 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0597  thioesterase superfamily protein  32.59 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2119  thioesterase  31.78 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.06428  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  28.99 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3386  thioesterase superfamily protein  33.63 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2654  thioesterase  34.56 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4018  thioesterase superfamily protein  32.98 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0916  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0132  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00894639  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  33.7 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2196  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0672  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1444  thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.084624  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  26.67 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  29.91 
 
 
130 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0833  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  25.55 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1094  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.75 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.31 
 
 
127 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
140 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  27.1 
 
 
155 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0608  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 
135 aa  60.1  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.45 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2936  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
131 aa  58.9  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.535343  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03885  hypothetical protein  29.13 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3714  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.14 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2049  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2255  thioesterase superfamily protein  29.81 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00034337  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3313  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.43 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000159774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1601  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.43 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000385666  hitchhiker  0.0000353735 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3626  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  26.43 
 
 
139 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00511508  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3401  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.43 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3363  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.43 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3667  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.43 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3617  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.43 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000115588 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3632  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.43 
 
 
139 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  28.83 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1462  thioesterase superfamily protein  25.56 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000224992  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1179  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1149  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  26.42 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>