156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5100 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5100  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  100 
 
 		 141 aa  294  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0431  thioesterase superfamily protein  95 
 
 		 149 aa  278  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0432  thioesterase superfamily protein  82.14 
 
 		 141 aa  242  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17123  normal  0.284958 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3386  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  56.59 
 
 		 143 aa  176  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0335  thioesterase superfamily protein  53.28 
 
 		 143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0439  thioesterase superfamily protein  54.14 
 
 		 144 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0333  thioesterase superfamily protein  53.28 
 
 		 143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0340  thioesterase superfamily protein  53.28 
 
 		 143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0343  thioesterase superfamily protein  53.28 
 
 		 143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0418657 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0343  thioesterase superfamily protein  54.26 
 
 		 144 aa  168  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3683  thioesterase superfamily protein  55.04 
 
 		 144 aa  169  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4375  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  55.81 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3518  thioesterase superfamily protein  52.17 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0345  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  52.71 
 
 		 143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0334  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  53.49 
 
 		 144 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3895  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  48.55 
 
 		 149 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3880  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  52.34 
 
 		 135 aa  159  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0318  thioesterase superfamily protein  47.06 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4603  thioesterase superfamily protein  50.38 
 
 		 154 aa  154  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0119  thioesterase  54.47 
 
 		 147 aa  149  8.999999999999999e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000833529  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00778  hypothetical protein  49.62 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0697  thioesterase superfamily protein  50.39 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0934  hypothetical protein  48.53 
 
 		 143 aa  147  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3057  thioesterase superfamily protein  47.79 
 
 		 143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0408994  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3605  thioesterase superfamily protein  53.6 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3916  thioesterase superfamily protein  58.62 
 
 		 143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0896  thioesterase superfamily protein  49.62 
 
 		 142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4080  thioesterase superfamily protein  53.6 
 
 		 142 aa  144  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.339486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4768  thioesterase superfamily protein  48.06 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4384  protein with predicted thioesterase domain-containing protein  52.14 
 
 		 138 aa  141  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00746999  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3691  thioesterase superfamily protein  48.06 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.36122 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4807  thioesterase superfamily protein  48.8 
 
 		 140 aa  138  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.777198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3892  thioesterase superfamily protein  48 
 
 		 140 aa  135  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1494  thioesterase superfamily protein  48.06 
 
 		 139 aa  133  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2096  putative thioesterase  47.2 
 
 		 152 aa  130  9e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004071  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  41.67 
 
 		 148 aa  127  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0973  thioesterase superfamily protein  41.41 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.192088  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0284  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  43.09 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000478521  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4575  thioesterase superfamily protein  41.41 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0434  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1692  thioesterase superfamily protein  35.82 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.662828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1860  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.484862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3609  thioesterase superfamily protein  35.94 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2119  thioesterase  33.85 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.06428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1993  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2654  thioesterase  34.71 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  33.86 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1694  thioesterase  35.19 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0239  hypothetical protein  34.09 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0185294  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  32.14 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04081  thioesterase  34.69 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.764654 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0597  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3139  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.09 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2196  thioesterase superfamily protein  39.47 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1149  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 163 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1179  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 163 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 155 aa  60.1  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3313  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.36 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000159774  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  31.86 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  31.86 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4018  thioesterase superfamily protein  34.12 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3401  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.46 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3363  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.46 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3667  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.46 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3714  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.46 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3617  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.46 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000115588 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0132  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00894639  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1094  thioesterase superfamily protein  26.87 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2255  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00034337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1601  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000385666  hitchhiker  0.0000353735 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  38.67 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3626  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  28.57 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00511508  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3632  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4077  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2049  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.74 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4502  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.43 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0641  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1260  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.4 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  29.85 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1575  thioesterase superfamily protein  32.67 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.242963 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0672  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  26.89 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  24 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0701  hypothetical protein  34.18 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00299166  normal  0.252492 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  34 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0916  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11031  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  28.24 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.212306  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03885  hypothetical protein  25.2 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.57 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10971  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  22.41 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.984698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>