157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1694 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1694  thioesterase  100 
 
 
146 aa  296  5e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04081  thioesterase  95.21 
 
 
146 aa  284  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.764654 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03521  thioesterase  49.26 
 
 
148 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22071  hypothetical protein  39.46 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10971  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  41.35 
 
 
137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.984698  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1860  hypothetical protein  39.57 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1023  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  41.46 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00412471  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0474  hypothetical protein  39.06 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.637818  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11021  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  41.46 
 
 
139 aa  107  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0792873  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11031  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  40.65 
 
 
139 aa  103  5e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.212306  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0701  hypothetical protein  30.77 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00299166  normal  0.252492 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3139  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.4 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1149  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1179  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1575  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.242963 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4502  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.47 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5100  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  35.19 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0345  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.73 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  30.43 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4077  thioesterase superfamily protein  36.71 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0641  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0431  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0432  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17123  normal  0.284958 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3386  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.94 
 
 
143 aa  62.8  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0318  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4603  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  32.32 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  27.19 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  27.19 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3518  thioesterase superfamily protein  29.67 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3895  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.19 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0597  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  29.59 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1860  thioesterase superfamily protein  30.11 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.484862  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4384  protein with predicted thioesterase domain-containing protein  29.73 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00746999  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0335  thioesterase superfamily protein  24.77 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0439  thioesterase superfamily protein  24.77 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0343  thioesterase superfamily protein  24.77 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0418657 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0333  thioesterase superfamily protein  24.77 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2255  thioesterase superfamily protein  27.72 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00034337  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0973  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.192088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4575  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0003  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
125 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00198303  unclonable  0.00000000031845 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0284  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  36.73 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000478521  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  26.73 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1601  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.73 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000385666  hitchhiker  0.0000353735 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4807  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 
140 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.777198  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2096  putative thioesterase  32.1 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4375  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.75 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0343  thioesterase superfamily protein  28.75 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3683  thioesterase superfamily protein  28.75 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0896  thioesterase superfamily protein  26.74 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155236  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0340  thioesterase superfamily protein  23.85 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3714  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.74 
 
 
139 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3401  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.74 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3363  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.74 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3313  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.74 
 
 
139 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000159774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3617  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.74 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000115588 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3667  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.74 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1993  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
137 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3892  thioesterase superfamily protein  26.97 
 
 
140 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1260  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28 
 
 
138 aa  51.2  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3880  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  26.61 
 
 
135 aa  51.2  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.58 
 
 
131 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3626  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  25.74 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00511508  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3632  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.74 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0334  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.5 
 
 
144 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.77 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00778  hypothetical protein  27.52 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.77 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0066  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004071  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  27.27 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  37.25 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2654  thioesterase  23.6 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.6 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0934  hypothetical protein  27.52 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1494  thioesterase superfamily protein  28.38 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  38 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0132  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00894639  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0119  thioesterase  38.78 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000833529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  26.55 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3691  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.36122 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4768  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283541  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3057  thioesterase superfamily protein  32.91 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0408994  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0672  thioesterase superfamily protein  37.25 
 
 
145 aa  47.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1523  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.27 
 
 
132 aa  47.4  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.010103  normal  0.859767 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0697  thioesterase superfamily protein  28.75 
 
 
143 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  35.85 
 
 
130 aa  47.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0239  hypothetical protein  28.42 
 
 
140 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0185294  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1094  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 
149 aa  47  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0434  thioesterase superfamily protein  36.73 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3605  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  22.58 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4080  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.339486  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>