193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3386 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3386  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  100 
 
 		 143 aa  301  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0334  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  72.03 
 
 		 144 aa  233  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3683  thioesterase superfamily protein  72.03 
 
 		 144 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0343  thioesterase superfamily protein  71.33 
 
 		 144 aa  231  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0340  thioesterase superfamily protein  73.24 
 
 		 143 aa  228  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0343  thioesterase superfamily protein  73.24 
 
 		 143 aa  227  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0418657 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0335  thioesterase superfamily protein  73.24 
 
 		 143 aa  227  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0333  thioesterase superfamily protein  73.24 
 
 		 143 aa  227  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0439  thioesterase superfamily protein  73.24 
 
 		 144 aa  226  8e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4375  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  70.42 
 
 		 144 aa  225  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0345  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  73.19 
 
 		 143 aa  224  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3895  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  72.03 
 
 		 149 aa  224  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4603  thioesterase superfamily protein  68.57 
 
 		 154 aa  218  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3518  thioesterase superfamily protein  68.75 
 
 		 144 aa  218  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0318  thioesterase superfamily protein  69.34 
 
 		 159 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5100  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  56.59 
 
 		 141 aa  176  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0432  thioesterase superfamily protein  51.47 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17123  normal  0.284958 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0431  thioesterase superfamily protein  53.28 
 
 		 149 aa  174  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4384  protein with predicted thioesterase domain-containing protein  55.22 
 
 		 138 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00746999  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4807  thioesterase superfamily protein  58.54 
 
 		 140 aa  166  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.777198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3892  thioesterase superfamily protein  58.54 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0934  hypothetical protein  53.62 
 
 		 143 aa  163  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3057  thioesterase superfamily protein  53.38 
 
 		 143 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0408994  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_003296  RS00778  hypothetical protein  51.88 
 
 		 144 aa  158  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0697  thioesterase superfamily protein  53.54 
 
 		 143 aa  155  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2096  putative thioesterase  50.76 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0896  thioesterase superfamily protein  54.55 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1494  thioesterase superfamily protein  46.04 
 
 		 139 aa  154  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3916  thioesterase superfamily protein  51.56 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3880  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  45.04 
 
 		 135 aa  149  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4080  thioesterase superfamily protein  50.38 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.339486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4575  thioesterase superfamily protein  52.38 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004071  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  46.92 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4768  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 144 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3691  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 144 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.36122 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3605  thioesterase superfamily protein  49.62 
 
 		 142 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0119  thioesterase  41.13 
 
 		 147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000833529  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0284  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  43.09 
 
 		 144 aa  123  9e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000478521  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0973  thioesterase superfamily protein  41.73 
 
 		 150 aa  120  6e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.192088  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0434  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1860  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.484862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2119  thioesterase  34.13 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.06428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1993  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0916  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5014  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3609  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  30.66 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2654  thioesterase  31.82 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.34 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  34.55 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.66 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  30.66 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  33.94 
 
 		 155 aa  67  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0833  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4018  thioesterase superfamily protein  26.81 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0132  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00894639  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1692  thioesterase superfamily protein  23.88 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.662828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  30.1 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1694  thioesterase  32.94 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.17 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  26.5 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0597  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  31.48 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  31.48 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  28.15 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  27.19 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04081  thioesterase  33.33 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.764654 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0239  hypothetical protein  25.37 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0185294  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2196  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2255  thioesterase superfamily protein  34.25 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00034337  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3626  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  29 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00511508  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1267  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000790915  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3632  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1601  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.29 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000385666  hitchhiker  0.0000353735 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3714  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.88 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3401  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.88 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3363  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.88 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3313  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.88 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000159774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3667  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.88 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3617  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.88 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000115588 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1260  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.85 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1094  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3386  thioesterase superfamily protein  25.71 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2049  thioesterase superfamily protein  24.77 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  25.71 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  25.71 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  23.62 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10971  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  27.03 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.984698  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0608  thioesterase superfamily protein  26.85 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1462  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000224992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>