135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0119 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0119  thioesterase  100 
 
 
147 aa  307  2.9999999999999997e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000833529  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5100  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  54.47 
 
 
141 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0431  thioesterase superfamily protein  53.23 
 
 
149 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0432  thioesterase superfamily protein  50.41 
 
 
141 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17123  normal  0.284958 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0318  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
159 aa  136  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4603  thioesterase superfamily protein  47.24 
 
 
154 aa  136  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4375  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  47.2 
 
 
144 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0335  thioesterase superfamily protein  47.24 
 
 
143 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0439  thioesterase superfamily protein  48 
 
 
144 aa  134  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0333  thioesterase superfamily protein  47.24 
 
 
143 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0340  thioesterase superfamily protein  47.24 
 
 
143 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0343  thioesterase superfamily protein  47.24 
 
 
143 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0418657 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3683  thioesterase superfamily protein  47.2 
 
 
144 aa  133  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0343  thioesterase superfamily protein  47.2 
 
 
144 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0334  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  47.2 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3518  thioesterase superfamily protein  47.54 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00778  hypothetical protein  49.14 
 
 
144 aa  131  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3691  thioesterase superfamily protein  47.58 
 
 
144 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.36122 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4768  thioesterase superfamily protein  47.58 
 
 
144 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283541  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0345  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  48.36 
 
 
143 aa  130  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3057  thioesterase superfamily protein  50.86 
 
 
143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0408994  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0934  hypothetical protein  46.88 
 
 
143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0697  thioesterase superfamily protein  46.77 
 
 
143 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3386  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.13 
 
 
143 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3895  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.65 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3880  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  43.22 
 
 
135 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4080  thioesterase superfamily protein  43.2 
 
 
142 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.339486  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3605  thioesterase superfamily protein  44.92 
 
 
142 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0973  thioesterase superfamily protein  41.35 
 
 
150 aa  121  4e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.192088  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0284  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  37.88 
 
 
144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000478521  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1494  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 
139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4384  protein with predicted thioesterase domain-containing protein  45.13 
 
 
138 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00746999  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0896  thioesterase superfamily protein  43.55 
 
 
142 aa  114  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155236  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3916  thioesterase superfamily protein  46.02 
 
 
143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445729  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004071  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  39.2 
 
 
148 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4807  thioesterase superfamily protein  43.48 
 
 
140 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.777198  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0434  thioesterase superfamily protein  36.88 
 
 
146 aa  102  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3892  thioesterase superfamily protein  40.87 
 
 
140 aa  101  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2096  putative thioesterase  38.4 
 
 
152 aa  101  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4575  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
140 aa  92  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1860  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.484862  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1692  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.662828  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1993  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
137 aa  67  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2119  thioesterase  37.1 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.06428  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3609  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
172 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0239  hypothetical protein  28.24 
 
 
140 aa  58.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0185294  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2196  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 
143 aa  57.4  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  27.72 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  25.38 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5014  thioesterase superfamily protein  24.6 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  26.97 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2654  thioesterase  31.25 
 
 
149 aa  52.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.29 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0916  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  23.01 
 
 
136 aa  51.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2049  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
138 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3139  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.55 
 
 
166 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  27.42 
 
 
145 aa  51.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  27.59 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0597  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.88 
 
 
127 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  24.3 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  26.55 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0132  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00894639  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1094  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4502  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.57 
 
 
161 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04081  thioesterase  32.86 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.764654 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4018  thioesterase superfamily protein  22.86 
 
 
133 aa  48.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1179  thioesterase superfamily protein  26.79 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1149  thioesterase superfamily protein  26.79 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1694  thioesterase  38.78 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  25.93 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  25.93 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1575  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.242963 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11031  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  31.75 
 
 
139 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.212306  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3386  thioesterase superfamily protein  19.63 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.14 
 
 
137 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1224  thioesterase family protein  31.43 
 
 
143 aa  46.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0347226  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.81 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1444  thioesterase superfamily protein  27.07 
 
 
129 aa  46.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.084624  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1596  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186946 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22071  hypothetical protein  31.87 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1023  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  33.33 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00412471  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0641  thioesterase superfamily protein  26.5 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10971  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  24.58 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.984698  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11021  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  31.58 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0792873  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0672  thioesterase superfamily protein  23.13 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.44 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  24.81 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.08 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1483  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203632  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  24.09 
 
 
137 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  18.46 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0474  hypothetical protein  40.38 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.637818  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1849  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.33 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  23.85 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1462  thioesterase superfamily protein  23.53 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000224992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>