100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1888 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1888  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 139 aa  288  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3576  thioesterase superfamily protein  88.49 
 
 		 139 aa  257  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1990  thioesterase superfamily protein  77.7 
 
 		 139 aa  234  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0483278  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7090  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  78.42 
 
 		 139 aa  230  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3016  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.396701 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14220  4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  43.28 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126924  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0444  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.82 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3115  thioesterase superfamily protein  32.82 
 
 		 140 aa  92  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2489  thioesterase superfamily protein  34.92 
 
 		 139 aa  87.4  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115223  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0799  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.28 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0270  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.86 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.4 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2312  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3039  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.24 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2827  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6462  thioesterase superfamily protein  30.22 
 
 		 151 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0170  thioesterase superfamily protein  30.48 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3245  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.61 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398056  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1329  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.866642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2197  thioesterase superfamily protein  36.96 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021618  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2179  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2232  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5092  thioesterase superfamily protein  27.03 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.144651  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02013  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  28.12 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2690  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0821  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0969  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.78 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.475786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0588  thioesterase superfamily protein  30.68 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  22.92 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3950  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  25 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0822744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3837  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  25 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.488766 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  22.92 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  20.3 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3622  thioesterase superfamily protein  23.48 
 
 		 146 aa  50.8  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.22745 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4467  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192711 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  21.88 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  25.22 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1590  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.228465  hitchhiker  0.00903187 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  25.26 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  24.8 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1841  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.26 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00333557  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0657  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1512  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  25 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0698  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  22.73 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2583  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  23.48 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4073  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7163  thioesterase superfamily protein  28.42 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0500589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  24.24 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  20.93 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2228  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.39 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.159905  hitchhiker  0.000289051 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0681  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.73 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  24.43 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0804  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.48 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0321  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.48 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0277  putative 4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  29.89 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.88 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1827  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  29.41 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01911  thioesterase  25.96 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0839  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  20.93 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000201976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.92 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  22.92 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00685  hypothetical protein  20.93 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00120853  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0658  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  20.93 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013537  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2899  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  20.93 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252575  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00696  predicted acyl-CoA thioesterase  20.93 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000730216  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  21.21 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0759  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  20.93 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000767242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2919  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  20.93 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000323269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0765  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  20.93 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133795  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0789  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  20.93 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115548  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.82 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2940  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  21.5 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  23.44 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.21 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0724  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  22.92 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.763036  normal  0.174534 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.04 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  26.09 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0833  thioesterase superfamily protein  20.34 
 
 		 137 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4370  thioesterase superfamily protein  25.49 
 
 		 138 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.327633  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2184  thioesterase superfamily protein  25.62 
 
 		 147 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315338  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2921  thioesterase superfamily protein  23.13 
 
 		 151 aa  41.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  25.45 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0773  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  21.97 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  21.8 
 
 		 159 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4765  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  24.24 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27301  thioesterase  24.04 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36680  acyl-coenzyme A thioester hydrolase  23.97 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51770  hypothetical protein  23.44 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1106  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  23.66 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.157487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2808  thioesterase superfamily protein  23.31 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.511725  hitchhiker  0.00696789 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1152  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  20.15 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5232  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  23.31 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200026  normal  0.202993 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  23.48 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1245  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  20.16 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0111113  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0787  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.22 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267485  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2960  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  19.38 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0218826  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2872  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  19.38 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000275881  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2906  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  20.93 
 
 		 134 aa  40  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1541  hypothetical protein  25.51 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3091  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  19.38 
 
 		 134 aa  40  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>