158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0588 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0588  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
145 aa  298  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3622  thioesterase superfamily protein  75.86 
 
 
146 aa  228  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.22745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1329  thioesterase superfamily protein  39.01 
 
 
133 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.866642  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1590  thioesterase superfamily protein  36.17 
 
 
144 aa  89  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.228465  hitchhiker  0.00903187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0821  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 
132 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4467  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
150 aa  84  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.192711 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1827  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  32.35 
 
 
148 aa  83.6  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115256  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0657  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02013  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  33.58 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1512  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  33.82 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3245  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.47 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398056  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5092  thioesterase superfamily protein  31.69 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.144651  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4073  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2179  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7163  thioesterase superfamily protein  32.86 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0500589  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0277  putative 4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  33.58 
 
 
147 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3950  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  32.09 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0822744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3837  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  32.09 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.488766 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2232  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2197  thioesterase superfamily protein  33.86 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021618  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2690  thioesterase superfamily protein  28.78 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0740  thioesterase superfamily protein  30.88 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0509002  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0777  thioesterase superfamily protein  30.88 
 
 
137 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0777  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3039  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.89 
 
 
138 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2808  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.511725  hitchhiker  0.00696789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.23 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3016  thioesterase superfamily protein  30.22 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.396701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7090  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.76 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  24.63 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1990  thioesterase superfamily protein  29.09 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0483278  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2063  thioesterase-like  26.62 
 
 
314 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.529459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1888  thioesterase superfamily protein  30.68 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0310  thioesterase superfamily protein  26.47 
 
 
136 aa  53.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.121979  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2489  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115223  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3576  thioesterase superfamily protein  28.41 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3023  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0605  thioesterase superfamily protein  22.4 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.646186  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0799  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.46 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117623  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  23.44 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2733  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2777  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259185  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2763  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205921  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  22.96 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  23.36 
 
 
136 aa  50.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2192  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.947686  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  25.9 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3115  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2577  thioesterase superfamily protein  24.72 
 
 
192 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.18 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1390  thioesterase superfamily protein  30.85 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  24.44 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0557  thioesterase superfamily protein  29.89 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.977538  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0532  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  24.81 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  22.83 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2098  thioesterase superfamily protein  22.66 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.206892 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14220  4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  26.77 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126924  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5014  thioesterase superfamily protein  22.96 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  26.12 
 
 
136 aa  47  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36680  acyl-coenzyme A thioester hydrolase  23.31 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0270  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.21 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  23.86 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0641  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  25.71 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3458  thioesterase superfamily protein  26.37 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0444  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.78 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4317  thioesterase superfamily protein  23.66 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.34 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  21.88 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0170  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3302  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192522  normal  0.395393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  20.77 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2827  thioesterase superfamily protein  25.38 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2411  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2464  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  23.36 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5307  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  24.43 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  21.95 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0681  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.32 
 
 
161 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.2 
 
 
131 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0698  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.32 
 
 
161 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3139  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.81 
 
 
166 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  21.71 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6462  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  24.65 
 
 
286 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.62 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2228  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.09 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.159905  hitchhiker  0.000289051 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1090  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25 
 
 
149 aa  43.5  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2384  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.76 
 
 
204 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29549  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1773  putative thioesterase protein  24.65 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2312  thioesterase superfamily protein  25.38 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4575  thioesterase superfamily protein  21.88 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0321  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.61 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  21.49 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0804  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.61 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1211  thioesterase superfamily protein  24.51 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.58 
 
 
148 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  23.08 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0397  thioesterase superfamily protein  28.42 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.995435  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3893  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.95 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>