86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1827 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1827  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  100 
 
 		 148 aa  308  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0657  thioesterase superfamily protein  69.57 
 
 		 140 aa  202  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1512  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  56.93 
 
 		 152 aa  157  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3950  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  51.88 
 
 		 143 aa  137  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0822744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3837  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  51.88 
 
 		 143 aa  137  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.488766 
 
 
-
 
NC_003296  RS02013  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  52.27 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4073  thioesterase superfamily protein  45.32 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0277  putative 4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  46.27 
 
 		 147 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7163  thioesterase superfamily protein  44.96 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0500589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1590  thioesterase superfamily protein  42.42 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.228465  hitchhiker  0.00903187 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4467  thioesterase superfamily protein  39.68 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0821  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 		 132 aa  93.6  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3245  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  38.93 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398056  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2197  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021618  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2179  thioesterase superfamily protein  38.21 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2690  thioesterase superfamily protein  40.48 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0588  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 		 145 aa  83.6  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3622  thioesterase superfamily protein  32.85 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.22745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2232  thioesterase superfamily protein  38.53 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1329  thioesterase superfamily protein  36.15 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.866642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5092  thioesterase superfamily protein  32.82 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.144651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2763  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205921  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2777  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2733  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352685  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4124  hypothetical protein  28 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3023  thioesterase superfamily protein  36.09 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2192  thioesterase superfamily protein  31.52 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.947686  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3302  thioesterase superfamily protein  35.46 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192522  normal  0.395393 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0777  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0740  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0509002  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2489  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.115223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0777  thioesterase superfamily protein  30.12 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14220  4-hydroxybenzoyl CoA thioesterase  30.56 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.126924  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6462  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0532  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  24.03 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2189  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2577  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 		 192 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 292 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2808  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.511725  hitchhiker  0.00696789 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3458  thioesterase superfamily protein  25.71 
 
 		 146 aa  47.4  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3016  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.396701 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3576  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4370  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.327633  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7090  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.11 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1990  thioesterase superfamily protein  32.22 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0483278  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4057  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.24 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1474  thioesterase superfamily protein  24.44 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291096  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1888  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.12 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1094  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92060  predicted protein  25.6 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.691769  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1744  hypothetical protein  27.35 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0304185  normal  0.745927 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3039  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.24 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  22.79 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.74 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  22.9 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1390  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.73 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00302966  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1596  thioesterase superfamily protein  32.05 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4765  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.32 
 
 		 153 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.56 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1603  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.73 
 
 		 133 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000704517  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  26.56 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5232  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.56 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200026  normal  0.202993 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2943  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.66 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000565224  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2027  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.06 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  24.67 
 
 		 286 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2435  hypothetical protein  26.15 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2568  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  21.26 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331427  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  28.12 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1433  thioesterase superfamily protein  22.96 
 
 		 149 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  20.63 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.26 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2735  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.66 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  27.47 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1692  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.662828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1742  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  21.97 
 
 		 133 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000282054  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1781  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  21.97 
 
 		 133 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000346998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1738  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  21.97 
 
 		 133 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000578703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>