192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3228 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3086  thioesterase family protein  100 
 
 		 135 aa  280  7.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3228  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 135 aa  280  7.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3047  hypothetical protein  99.26 
 
 		 135 aa  276  5e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  69.47 
 
 		 132 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0496  thioesterase superfamily protein  69.47 
 
 		 132 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0557  thioesterase superfamily protein  69.47 
 
 		 132 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  69.47 
 
 		 132 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.159838 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00395  hypothetical protein  69.47 
 
 		 132 aa  195  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3166  thioesterase superfamily protein  69.47 
 
 		 132 aa  195  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118227  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0366  thioesterase family protein  69.47 
 
 		 132 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.356358  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0486  thioesterase family protein  69.47 
 
 		 132 aa  195  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00849575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00399  hypothetical protein  69.47 
 
 		 132 aa  195  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3189  thioesterase superfamily protein  69.47 
 
 		 132 aa  195  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590912  normal  0.0179744 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0520  thioesterase family protein  69.47 
 
 		 132 aa  195  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00162473  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0479  thioesterase family protein  69.47 
 
 		 132 aa  195  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0624989  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0494  thioesterase superfamily protein  68.7 
 
 		 132 aa  194  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0529  thioesterase family protein  68.7 
 
 		 132 aa  192  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.107465  normal  0.895725 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1101  thioesterase superfamily protein  65.91 
 
 		 137 aa  190  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151637  hitchhiker  0.00000232326 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  65.65 
 
 		 132 aa  188  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1054  thioesterase superfamily protein  67.69 
 
 		 132 aa  183  8e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3258  thioesterase superfamily protein  66.92 
 
 		 132 aa  180  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.26455  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1601  thioesterase superfamily protein  42.06 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0532  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.73 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2943  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000565224  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  31.3 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0715  hypothetical protein  36.47 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1852  thioesterase  27.78 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304931  normal  0.230458 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2906  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  40 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1215  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.26 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02688  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.74 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000607478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2718  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.04 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.401419  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2027  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.93 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 166 aa  52.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  28.07 
 
 		 130 aa  52  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  28.07 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  31.62 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.62 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.53 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  30.48 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.55 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  27.07 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0066  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4467  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192711 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  28.93 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1245  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  32.04 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0111113  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3091  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  33.01 
 
 		 134 aa  50.4  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.7 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  24.29 
 
 		 180 aa  50.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  29.21 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2872  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  32.69 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000275881  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1152  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  35.58 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2960  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  32.69 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0218826  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1703  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0741756  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0258  thioesterase  30.7 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024858  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0658  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.77 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013537  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00696  predicted acyl-CoA thioesterase  30.77 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000730216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2899  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.77 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252575  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0839  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.77 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000201976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00685  hypothetical protein  30.77 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00120853  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0759  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.77 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000767242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0789  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.77 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0765  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.77 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133795  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2919  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.77 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000323269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1090  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.73 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0472  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.563842  normal  0.634378 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.91 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.85 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.5 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  25.21 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.72 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  30.19 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1727  hypothetical protein  30.08 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11790  predicted thioesterase  27.74 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.347124 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  23.85 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2088  thioesterase superfamily protein  26.25 
 
 		 172 aa  46.2  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0701074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 283 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1234  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.77 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.128192 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  24.22 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0840  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  28.85 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  0.646292 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0902  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  28.85 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000167631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2516  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.780106  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2812  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1444  thioesterase superfamily protein  28.07 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.084624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  41.54 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0807  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  28.85 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000852325  normal  0.479233 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0003  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00198303  unclonable  0.00000000031845 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0780  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  28.85 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000472439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>