282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1373 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
283 aa  570  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  47.14 
 
 
167 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  46.76 
 
 
144 aa  112  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3424  thioesterase superfamily protein  49.25 
 
 
147 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996991  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3541  thioesterase superfamily protein  41.1 
 
 
148 aa  109  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564899  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  45.52 
 
 
137 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3916  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 
148 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.539762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  40.91 
 
 
134 aa  106  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  45.04 
 
 
129 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  41.3 
 
 
143 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  42.96 
 
 
132 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  42.75 
 
 
141 aa  99.4  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  43.61 
 
 
145 aa  98.6  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1132  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 
146 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08950  predicted thioesterase  34.69 
 
 
183 aa  85.9  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.936041  normal  0.0657601 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11790  predicted thioesterase  40.71 
 
 
146 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.347124 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  33.54 
 
 
150 aa  79  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0934  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 
181 aa  75.5  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
155 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2639  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 
166 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0958965  normal  0.564769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  33.6 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1095  thioesterase superfamily protein  31.76 
 
 
160 aa  67.8  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1355  thioesterase superfamily protein  31.29 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
143 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 
131 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  33.33 
 
 
147 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
146 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
149 aa  63.5  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
143 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
143 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
146 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24680  predicted thioesterase  29.94 
 
 
182 aa  62.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.489708  normal  0.117336 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  35.87 
 
 
149 aa  62.4  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
132 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  34.4 
 
 
148 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0300  thioesterase superfamily protein  28.99 
 
 
145 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.535288  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04420  predicted thioesterase  32.17 
 
 
148 aa  59.7  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17668  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  32.59 
 
 
130 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 
139 aa  59.7  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
136 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 
143 aa  59.7  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1386  hypothetical protein  33.59 
 
 
158 aa  59.3  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.402075  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2028  thioesterase superfamily protein  31.37 
 
 
166 aa  58.9  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 
213 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  34.91 
 
 
163 aa  58.9  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0973  hypothetical protein  28.37 
 
 
138 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0326933 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
149 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
137 aa  58.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  34.45 
 
 
147 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  33.58 
 
 
151 aa  57.4  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
139 aa  57.4  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
136 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 
132 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  36.92 
 
 
203 aa  57  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 
132 aa  57  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 
142 aa  56.6  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  28.72 
 
 
150 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  40.45 
 
 
134 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
145 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11530  predicted thioesterase  30.37 
 
 
173 aa  56.2  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  29.21 
 
 
139 aa  55.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  26.92 
 
 
135 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 
136 aa  55.8  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00395  hypothetical protein  28.78 
 
 
132 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3166  thioesterase superfamily protein  28.78 
 
 
132 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118227  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  30.94 
 
 
136 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.37 
 
 
142 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 
162 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0366  thioesterase family protein  28.78 
 
 
132 aa  55.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.356358  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  32.91 
 
 
133 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0486  thioesterase family protein  28.78 
 
 
132 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00849575  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  32.88 
 
 
147 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  30.17 
 
 
134 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 
142 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0529  thioesterase family protein  28.78 
 
 
132 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.107465  normal  0.895725 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0479  thioesterase family protein  28.78 
 
 
132 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0624989  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0520  thioesterase family protein  28.78 
 
 
132 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00162473  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  43.94 
 
 
134 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3189  thioesterase superfamily protein  28.78 
 
 
132 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590912  normal  0.0179744 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00399  hypothetical protein  28.78 
 
 
132 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  33.08 
 
 
150 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  28.72 
 
 
150 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
153 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
140 aa  54.7  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  34.04 
 
 
130 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  28.72 
 
 
146 aa  54.7  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 
149 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 
154 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 
154 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 
154 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  33.86 
 
 
137 aa  54.3  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 
134 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  34.27 
 
 
181 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  34.27 
 
 
181 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 
144 aa  53.9  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 
150 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4068  hypothetical protein  30.43 
 
 
139 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
132 aa  54.3  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>