104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11790 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11790  predicted thioesterase  100 
 
 		 146 aa  293  5e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.347124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1132  thioesterase superfamily protein  52.94 
 
 		 146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  43.87 
 
 		 150 aa  105  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3916  thioesterase superfamily protein  42.54 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.539762 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3541  thioesterase superfamily protein  40.85 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  41.48 
 
 		 167 aa  100  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  41.41 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0300  thioesterase superfamily protein  35.82 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.535288  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4076  hypothetical protein  37.31 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  40.71 
 
 		 283 aa  85.5  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  39.1 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  38.1 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  36.51 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12499  hypothetical protein  37.5 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.113842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4068  hypothetical protein  33.82 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3424  thioesterase superfamily protein  37.59 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996991  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2028  thioesterase superfamily protein  36.69 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3613  hypothetical protein  32.59 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3686  hypothetical protein  32.59 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3618  hypothetical protein  32.59 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.30176 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08950  predicted thioesterase  32.67 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.936041  normal  0.0657601 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0934  thioesterase superfamily protein  35.88 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2570  hypothetical protein  31.85 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.435252  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1386  hypothetical protein  37.5 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.402075  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  38.13 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1355  thioesterase superfamily protein  33.54 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04420  predicted thioesterase  35.29 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17668  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  33.82 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  33.86 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  30.66 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1095  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  34.96 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2639  thioesterase superfamily protein  29.14 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0958965  normal  0.564769 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24680  predicted thioesterase  29.59 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.489708  normal  0.117336 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  34.48 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11530  predicted thioesterase  31.03 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  30.48 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0973  hypothetical protein  28.79 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0326933 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  35.42 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1101  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151637  hitchhiker  0.00000232326 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1090  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.39 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0729  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.09 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  35.42 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3258  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.26455  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3047  hypothetical protein  27.74 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3086  thioesterase family protein  27.74 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112575  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6384  thioesterase superfamily protein  32.88 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0187489  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3228  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1413  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364047  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  35.42 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.77 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  32.22 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1054  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.5 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.7 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  34.83 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  23.36 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  30.11 
 
 		 137 aa  42.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0859  hypothetical protein  28.79 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.71 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.71 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1492  putative thioesterase  33.33 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.71 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.71 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  28.71 
 
 		 148 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.71 
 
 		 148 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  40.91 
 
 		 147 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1215  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  37.21 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.71 
 
 		 148 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.17 
 
 		 148 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1238  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 127 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.106775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2936  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.535343  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3205  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.28 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473316  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  22.88 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  25.66 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  25.66 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 		 143 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 		 143 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1456  esterase  30.65 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.711822  normal  0.158502 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>