94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3424 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3424  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
147 aa  295  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996991  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  59.7 
 
 
144 aa  152  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  50.4 
 
 
145 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  46.62 
 
 
167 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  50.77 
 
 
143 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  51.59 
 
 
137 aa  120  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  49.25 
 
 
283 aa  110  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3541  thioesterase superfamily protein  43.88 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564899  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3916  thioesterase superfamily protein  43.88 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.539762 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  43.09 
 
 
129 aa  92.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  41.54 
 
 
132 aa  90.1  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  39.52 
 
 
134 aa  84  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0934  thioesterase superfamily protein  40.85 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  41.84 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  40.77 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  41.46 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2639  thioesterase superfamily protein  37.58 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0958965  normal  0.564769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11790  predicted thioesterase  37.59 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.347124 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1355  thioesterase superfamily protein  36.42 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1132  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1095  thioesterase superfamily protein  33.11 
 
 
160 aa  72  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4068  hypothetical protein  32.03 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  39.81 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  42.99 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0300  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.535288  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4076  hypothetical protein  31.01 
 
 
144 aa  66.6  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2028  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08950  predicted thioesterase  30.77 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.936041  normal  0.0657601 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1386  hypothetical protein  33.59 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.402075  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2570  hypothetical protein  30.83 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.435252  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12499  hypothetical protein  31.5 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.113842 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  38.84 
 
 
148 aa  62  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3613  hypothetical protein  29.69 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3686  hypothetical protein  29.69 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3618  hypothetical protein  29.69 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.30176 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  40.4 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  38.83 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 
135 aa  58.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24680  predicted thioesterase  30.57 
 
 
182 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.489708  normal  0.117336 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  32.79 
 
 
134 aa  57.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  29.66 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11530  predicted thioesterase  32.87 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  26.89 
 
 
147 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  30.34 
 
 
151 aa  50.8  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0973  hypothetical protein  28.68 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0326933 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  30.37 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04420  predicted thioesterase  30.37 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17668  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  24.24 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  34.55 
 
 
163 aa  47  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  25.95 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  26.85 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
149 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0859  hypothetical protein  29.01 
 
 
133 aa  43.9  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0929  thioesterase family protein  22.31 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  25.62 
 
 
134 aa  43.5  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
136 aa  42.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  29.61 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  31.37 
 
 
180 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1413  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 
145 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364047  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 
140 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.7 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.33 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.7 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.78 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.7 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  28.7 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.7 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  23.26 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.72 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.7 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  31.25 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0257  thioesterase superfamily protein  28.99 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  29.69 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  25 
 
 
156 aa  40.4  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 
136 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>