114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0300 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0300  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
145 aa  300  3.0000000000000004e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.535288  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4076  hypothetical protein  67.38 
 
 
144 aa  202  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2028  thioesterase superfamily protein  46.67 
 
 
166 aa  136  7.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2570  hypothetical protein  48.51 
 
 
139 aa  133  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.435252  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4068  hypothetical protein  46.76 
 
 
139 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12499  hypothetical protein  43.8 
 
 
138 aa  124  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.113842 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3613  hypothetical protein  47.01 
 
 
137 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3686  hypothetical protein  47.01 
 
 
137 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3618  hypothetical protein  47.01 
 
 
137 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.30176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1386  hypothetical protein  43.57 
 
 
158 aa  124  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.402075  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11790  predicted thioesterase  35.82 
 
 
146 aa  90.5  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.347124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  34.59 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  35.88 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1132  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 
146 aa  80.1  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08950  predicted thioesterase  28.97 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.936041  normal  0.0657601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1355  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  38.39 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3541  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564899  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3424  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996991  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0973  hypothetical protein  30.6 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0326933 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0934  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3916  thioesterase superfamily protein  28.48 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.539762 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  27.64 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1095  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
160 aa  61.2  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0859  hypothetical protein  31.85 
 
 
133 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  28.68 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  28.99 
 
 
283 aa  60.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  23.91 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2639  thioesterase superfamily protein  28.87 
 
 
166 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0958965  normal  0.564769 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04420  predicted thioesterase  26.06 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17668  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  37.88 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11530  predicted thioesterase  28.08 
 
 
173 aa  55.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
139 aa  53.9  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
136 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  34.85 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  45.65 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  33.82 
 
 
133 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
138 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24680  predicted thioesterase  24.05 
 
 
182 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.489708  normal  0.117336 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  29.41 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
140 aa  50.1  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
140 aa  50.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  41.3 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  26.67 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  41.38 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  30.19 
 
 
213 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  32.86 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  31.31 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  31.31 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  31.31 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  31.31 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  38.18 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  32.63 
 
 
132 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  28.3 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  31.58 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0597  thioesterase superfamily protein  22.69 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  42.86 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  42.86 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  42.86 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  42.86 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  42.86 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  42.86 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  42.86 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  29.58 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
132 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2733  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2777  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259185  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2763  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205921  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  24 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1456  esterase  25.81 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.711822  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  36.21 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
134 aa  42.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  27.08 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.21 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  53.33 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  53.33 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.21 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.21 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.21 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.21 
 
 
148 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  22.95 
 
 
155 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>