154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0934 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0934  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
181 aa  374  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1355  thioesterase superfamily protein  59.01 
 
 
164 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24680  predicted thioesterase  50.56 
 
 
182 aa  167  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.489708  normal  0.117336 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2639  thioesterase superfamily protein  54.6 
 
 
166 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0958965  normal  0.564769 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1095  thioesterase superfamily protein  52.83 
 
 
160 aa  153  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11530  predicted thioesterase  46.25 
 
 
173 aa  124  8.000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08950  predicted thioesterase  38.17 
 
 
183 aa  108  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.936041  normal  0.0657601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  45.65 
 
 
141 aa  107  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  36.24 
 
 
155 aa  98.6  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0973  hypothetical protein  39.29 
 
 
138 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0326933 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  39.61 
 
 
149 aa  96.3  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  42.96 
 
 
167 aa  92.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 
159 aa  92.4  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 
129 aa  90.5  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  36.77 
 
 
149 aa  89.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  36.62 
 
 
134 aa  89.4  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  39.39 
 
 
145 aa  87  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1132  thioesterase superfamily protein  36.49 
 
 
146 aa  87  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04420  predicted thioesterase  34.69 
 
 
148 aa  84.7  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17668  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  39.69 
 
 
144 aa  84.3  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0859  hypothetical protein  38.69 
 
 
133 aa  84.3  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3424  thioesterase superfamily protein  40.85 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996991  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  37.86 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 
143 aa  77.4  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  36.09 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11790  predicted thioesterase  35.88 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.347124 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 
150 aa  72  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0300  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.535288  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1386  hypothetical protein  29.03 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.402075  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4076  hypothetical protein  32.06 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3541  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564899  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2570  hypothetical protein  32.09 
 
 
139 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.435252  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3916  thioesterase superfamily protein  32.87 
 
 
148 aa  63.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.539762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4068  hypothetical protein  31.62 
 
 
139 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  31.45 
 
 
134 aa  60.5  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
136 aa  59.3  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  37.9 
 
 
136 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
135 aa  58.5  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  31.72 
 
 
135 aa  57.4  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  31.85 
 
 
151 aa  57.4  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  32.37 
 
 
132 aa  56.6  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3613  hypothetical protein  30.71 
 
 
137 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3686  hypothetical protein  30.71 
 
 
137 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3618  hypothetical protein  30.71 
 
 
137 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.30176 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 
139 aa  55.1  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 
136 aa  53.9  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  29.93 
 
 
142 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 
139 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  29.86 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  29.93 
 
 
143 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  29.93 
 
 
143 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  29.93 
 
 
143 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
130 aa  51.2  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  27.03 
 
 
156 aa  50.8  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  31.82 
 
 
134 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
149 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
132 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
146 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
146 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
139 aa  50.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 
142 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 
132 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 
136 aa  49.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  31.73 
 
 
137 aa  49.3  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12499  hypothetical protein  30.56 
 
 
138 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.113842 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
143 aa  48.9  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2028  thioesterase superfamily protein  26.35 
 
 
166 aa  48.5  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 
134 aa  48.1  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 
148 aa  48.5  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  26.71 
 
 
139 aa  47.8  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  29.2 
 
 
147 aa  47.8  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  28.47 
 
 
143 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  28.47 
 
 
143 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
154 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
154 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  28.47 
 
 
143 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  28.47 
 
 
143 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  28.47 
 
 
159 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  28.47 
 
 
143 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  28.47 
 
 
143 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  41.11 
 
 
134 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 
149 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  29.2 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.2 
 
 
148 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.2 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 
141 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  40 
 
 
134 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.7 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.2 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.65 
 
 
142 aa  45.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 
145 aa  46.2  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0078  thioesterase superfamily protein  27.15 
 
 
136 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 
154 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0082  thioesterase superfamily protein  27.15 
 
 
136 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.691992 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
150 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  53.19 
 
 
156 aa  45.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>