97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3541 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3541  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
148 aa  298  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564899  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3916  thioesterase superfamily protein  93.84 
 
 
148 aa  278  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.539762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  56.52 
 
 
132 aa  152  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  41.1 
 
 
283 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  43.66 
 
 
167 aa  107  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  46.1 
 
 
144 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11790  predicted thioesterase  40.85 
 
 
146 aa  104  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.347124 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  39.42 
 
 
129 aa  103  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  37.86 
 
 
145 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  38.85 
 
 
137 aa  98.6  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3424  thioesterase superfamily protein  43.88 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996991  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  36.55 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
134 aa  94.7  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1132  thioesterase superfamily protein  39.13 
 
 
146 aa  94  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  36.17 
 
 
143 aa  91.3  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  38.78 
 
 
141 aa  83.6  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08950  predicted thioesterase  34.62 
 
 
183 aa  82  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.936041  normal  0.0657601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1355  thioesterase superfamily protein  35.22 
 
 
164 aa  79  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  36.15 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2639  thioesterase superfamily protein  30.87 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0958965  normal  0.564769 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04420  predicted thioesterase  37.5 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17668  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1095  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0300  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.535288  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  35.21 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1386  hypothetical protein  34.31 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.402075  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11530  predicted thioesterase  32.47 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0934  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24680  predicted thioesterase  29.24 
 
 
182 aa  64.3  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.489708  normal  0.117336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4076  hypothetical protein  26.71 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  29.2 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3185  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 
140 aa  53.9  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0973  hypothetical protein  28.08 
 
 
138 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0326933 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 
148 aa  53.5  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2028  thioesterase superfamily protein  25.85 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  30.19 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  27.86 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3618  hypothetical protein  27.7 
 
 
137 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.30176 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
139 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3686  hypothetical protein  27.7 
 
 
137 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3613  hypothetical protein  27.7 
 
 
137 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  32.98 
 
 
149 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12499  hypothetical protein  28.08 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.113842 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  30.19 
 
 
134 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  25.33 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  33.67 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4068  hypothetical protein  28.95 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2570  hypothetical protein  28.08 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.435252  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  28.99 
 
 
145 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  28.28 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  23.53 
 
 
130 aa  47  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  25.38 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  24.41 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  35.71 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  25 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  26.81 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0859  hypothetical protein  27.45 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  25.58 
 
 
149 aa  44.3  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  32.86 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  32.86 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  23.26 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  24.14 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  32.86 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  32.86 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  32.86 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  34.25 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  29.93 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 
213 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  24.44 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  23.36 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  23.4 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6384  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0187489  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  26.24 
 
 
136 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
163 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0568  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
143 aa  42  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  57.69 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4356  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.509436 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  32.88 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  23.31 
 
 
156 aa  40.8  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0397  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.995435  normal  0.293659 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  24.26 
 
 
161 aa  40.8  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  24.46 
 
 
143 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  25.71 
 
 
156 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>