129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1132 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1132  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
146 aa  290  6e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11790  predicted thioesterase  52.94 
 
 
146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.347124 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  48.98 
 
 
150 aa  122  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 
283 aa  97.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3916  thioesterase superfamily protein  39.01 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.539762 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3541  thioesterase superfamily protein  39.13 
 
 
148 aa  94  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564899  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
129 aa  93.6  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  43.31 
 
 
167 aa  93.6  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  37.68 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  39.42 
 
 
132 aa  90.1  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  40.15 
 
 
134 aa  90.1  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2028  thioesterase superfamily protein  38.26 
 
 
166 aa  87.4  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0934  thioesterase superfamily protein  36.49 
 
 
181 aa  87  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4076  hypothetical protein  37.31 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08950  predicted thioesterase  38.73 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.936041  normal  0.0657601 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12499  hypothetical protein  37.96 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.113842 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  41.98 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0300  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 
145 aa  80.1  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.535288  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4068  hypothetical protein  35.04 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  36.72 
 
 
137 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  36.3 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2570  hypothetical protein  33.58 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.435252  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3424  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996991  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  37.69 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3613  hypothetical protein  33.58 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3686  hypothetical protein  33.58 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3618  hypothetical protein  33.58 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.30176 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1355  thioesterase superfamily protein  36.73 
 
 
164 aa  70.1  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  37.1 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2639  thioesterase superfamily protein  35.86 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0958965  normal  0.564769 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1095  thioesterase superfamily protein  34.44 
 
 
160 aa  67  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  36.64 
 
 
130 aa  67  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  28.47 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  35.94 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  38.02 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1386  hypothetical protein  39.84 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.402075  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24680  predicted thioesterase  32.48 
 
 
182 aa  63.5  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.489708  normal  0.117336 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04420  predicted thioesterase  35.42 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17668  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  34.35 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  35.94 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0973  hypothetical protein  30.22 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0326933 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  33.06 
 
 
134 aa  57.4  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11530  predicted thioesterase  31.97 
 
 
173 aa  54.3  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  33.82 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
180 aa  52  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  28.06 
 
 
137 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 
135 aa  51.6  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
143 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
136 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  37.36 
 
 
134 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3970  thioesterase superfamily protein  27.86 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  30.63 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  38.82 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0859  hypothetical protein  29.41 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  30.23 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
142 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 
132 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1618  thioesterase family protein  29.69 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  30.86 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  23.66 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1849  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  25.29 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1875  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  21.67 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  24.22 
 
 
162 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  29.63 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
213 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  22.5 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  31.93 
 
 
159 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  31.93 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  31.93 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  29.11 
 
 
140 aa  43.5  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  31.93 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  31.93 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  31.93 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  31.93 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  23.08 
 
 
144 aa  43.5  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1090  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.1 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1413  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>