174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4185 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
134 aa  280  6.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3970  thioesterase superfamily protein  72.18 
 
 
155 aa  216  7.999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0077  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  72.18 
 
 
138 aa  206  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  70.15 
 
 
136 aa  205  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0080  thioesterase superfamily protein  70.9 
 
 
136 aa  204  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4272  thioesterase superfamily protein  70.9 
 
 
136 aa  204  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0078  thioesterase superfamily protein  70.9 
 
 
136 aa  204  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0082  thioesterase superfamily protein  70.9 
 
 
136 aa  204  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.691992 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0077  thioesterase superfamily protein  70.9 
 
 
136 aa  203  5e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4859  thioesterase superfamily protein  68.42 
 
 
134 aa  202  9e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4458  thioesterase superfamily protein  67.91 
 
 
134 aa  202  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.913504 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0082  thioesterase superfamily protein  70.15 
 
 
136 aa  201  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0080  thioesterase superfamily protein  70.15 
 
 
136 aa  200  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  63.43 
 
 
134 aa  194  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  61.94 
 
 
135 aa  189  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3570  thioesterase superfamily protein  66.93 
 
 
132 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  50 
 
 
133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0145  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 
135 aa  136  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  48.06 
 
 
139 aa  136  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0929  thioesterase family protein  44.72 
 
 
131 aa  130  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0326  hypothetical protein  44.8 
 
 
135 aa  128  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  43.65 
 
 
137 aa  127  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 
136 aa  128  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  44.8 
 
 
135 aa  128  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  44.8 
 
 
135 aa  128  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  41.6 
 
 
147 aa  121  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  38.17 
 
 
135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  37.5 
 
 
129 aa  110  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 
133 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1939  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 
145 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3185  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
143 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 
131 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  37.19 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  27.19 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  26.83 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0257  thioesterase superfamily protein  26.23 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  27.43 
 
 
145 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 
162 aa  57.4  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 
155 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3156  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  23.39 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  23.02 
 
 
149 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  28.36 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  24.6 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
149 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  26.27 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.25 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.25 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.25 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  28.8 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1681  putative Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  23.26 
 
 
163 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  0.0917493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 
137 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
134 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  31.25 
 
 
148 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.25 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.25 
 
 
148 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1972  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
162 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.25 
 
 
148 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 
283 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  28.18 
 
 
130 aa  50.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  27.64 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.36 
 
 
148 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4476  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  27.27 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  24.22 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  28.07 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  23.88 
 
 
159 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.1 
 
 
148 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  23.26 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  26.52 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  26.32 
 
 
203 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  27.78 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  24.43 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 
142 aa  47.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  23.08 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  24.43 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  19.26 
 
 
147 aa  47.4  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  27.72 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>