235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2301 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
149 aa  306  6.999999999999999e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 
149 aa  100  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0934  thioesterase superfamily protein  39.61 
 
 
181 aa  96.3  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2639  thioesterase superfamily protein  37.95 
 
 
166 aa  94.7  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0958965  normal  0.564769 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
155 aa  94.7  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1095  thioesterase superfamily protein  37.89 
 
 
160 aa  90.1  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1355  thioesterase superfamily protein  40.24 
 
 
164 aa  89.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 
167 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24680  predicted thioesterase  36.36 
 
 
182 aa  89  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.489708  normal  0.117336 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  38.13 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  37.09 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11530  predicted thioesterase  33.97 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  34.81 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  36.64 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08950  predicted thioesterase  31.21 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.936041  normal  0.0657601 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  31.82 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  34.85 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4076  hypothetical protein  41.07 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1132  thioesterase superfamily protein  37.1 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3424  thioesterase superfamily protein  39.81 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996991  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  34.4 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0300  thioesterase superfamily protein  38.39 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.535288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  35.56 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  35 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04420  predicted thioesterase  32.14 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17668  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4068  hypothetical protein  34.86 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  32.33 
 
 
151 aa  62.8  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12499  hypothetical protein  32.69 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.113842 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  30.23 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  35.87 
 
 
283 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  29.01 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  32.82 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  28.03 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2570  hypothetical protein  32.71 
 
 
139 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.435252  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
150 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0973  hypothetical protein  34.43 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0326933 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3613  hypothetical protein  37.65 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3686  hypothetical protein  37.65 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3618  hypothetical protein  37.65 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.30176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  27.13 
 
 
147 aa  57  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  31.3 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  29.69 
 
 
130 aa  57  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 
163 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  35.54 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.62 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 
145 aa  54.7  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 
139 aa  55.1  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
132 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  28.12 
 
 
130 aa  53.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 
156 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  23.7 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  23.7 
 
 
150 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 
161 aa  52.8  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  23.7 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  28.46 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  27.78 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  28.46 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0145  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  23.7 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  30.37 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  28.46 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  28.46 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  28.46 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  28.46 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  28.46 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  23.7 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 
147 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  29.63 
 
 
203 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3541  thioesterase superfamily protein  32.98 
 
 
148 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564899  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 
147 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 
136 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.96 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>