151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08950 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_08950  predicted thioesterase  100 
 
 
183 aa  371  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.936041  normal  0.0657601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  46.67 
 
 
141 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0934  thioesterase superfamily protein  38.17 
 
 
181 aa  108  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1355  thioesterase superfamily protein  40.57 
 
 
164 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2639  thioesterase superfamily protein  41.76 
 
 
166 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0958965  normal  0.564769 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  38.93 
 
 
132 aa  95.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1095  thioesterase superfamily protein  37.87 
 
 
160 aa  94.4  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  37.33 
 
 
134 aa  94.4  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  37.27 
 
 
145 aa  92.4  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  37.66 
 
 
159 aa  89.4  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  35.19 
 
 
167 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24680  predicted thioesterase  36.22 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.489708  normal  0.117336 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  34.69 
 
 
283 aa  85.9  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11530  predicted thioesterase  33.15 
 
 
173 aa  85.9  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  38.03 
 
 
144 aa  85.5  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  36.88 
 
 
129 aa  85.1  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  35.62 
 
 
137 aa  83.6  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1132  thioesterase superfamily protein  38.73 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3541  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 
148 aa  82  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564899  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3916  thioesterase superfamily protein  33.97 
 
 
148 aa  82  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.539762 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0973  hypothetical protein  31.17 
 
 
138 aa  80.5  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0326933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  32.87 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  31.21 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  33.12 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11790  predicted thioesterase  32.67 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.347124 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  35.06 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  31.21 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2028  thioesterase superfamily protein  31.33 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0859  hypothetical protein  31.72 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0300  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.535288  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12499  hypothetical protein  33.57 
 
 
138 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.113842 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  29.49 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2570  hypothetical protein  30.07 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.435252  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3613  hypothetical protein  31.94 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3686  hypothetical protein  31.94 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4068  hypothetical protein  31.47 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3618  hypothetical protein  31.94 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.30176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4076  hypothetical protein  31.08 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3424  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996991  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04420  predicted thioesterase  26.71 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17668  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
136 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  31.94 
 
 
130 aa  58.9  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1386  hypothetical protein  28.98 
 
 
158 aa  58.5  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.402075  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  35.96 
 
 
134 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  26.85 
 
 
139 aa  57  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  37.21 
 
 
134 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
136 aa  55.5  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
132 aa  53.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  32.97 
 
 
133 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  28.39 
 
 
140 aa  52.4  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  29.91 
 
 
147 aa  52.4  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 
213 aa  52  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  31.29 
 
 
145 aa  51.2  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 
142 aa  51.2  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
143 aa  51.2  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
143 aa  51.2  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 
140 aa  51.2  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
143 aa  51.2  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
139 aa  51.2  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 
146 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 
146 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 
149 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  28.26 
 
 
134 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04590  conserved hypothetical protein  24.2 
 
 
291 aa  48.1  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  25.83 
 
 
139 aa  48.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 
132 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  27.61 
 
 
145 aa  47.8  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 
132 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 
149 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  32.67 
 
 
147 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  34.31 
 
 
147 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  25.23 
 
 
150 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  26.72 
 
 
159 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  25.47 
 
 
150 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  24.58 
 
 
140 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  23.33 
 
 
140 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  25.68 
 
 
139 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  32.99 
 
 
137 aa  47  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  27.47 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  24.65 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
136 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  30.43 
 
 
143 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  30.43 
 
 
143 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
155 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
135 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  30.43 
 
 
143 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 
162 aa  46.2  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  30.43 
 
 
143 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  30.43 
 
 
143 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  30.43 
 
 
143 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
139 aa  45.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  22.54 
 
 
143 aa  45.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  25.95 
 
 
134 aa  45.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 
142 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.21 
 
 
142 aa  45.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  26.37 
 
 
154 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  26.37 
 
 
154 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  21.57 
 
 
142 aa  45.4  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  22 
 
 
142 aa  45.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 
163 aa  45.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.119468 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>