125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4076 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4076  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  297  4e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0300  thioesterase superfamily protein  67.38 
 
 		 145 aa  202  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.535288  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2570  hypothetical protein  54.41 
 
 		 139 aa  140  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.435252  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4068  hypothetical protein  51.47 
 
 		 139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0284957  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2028  thioesterase superfamily protein  45.77 
 
 		 166 aa  133  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3613  hypothetical protein  51.85 
 
 		 137 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3686  hypothetical protein  51.85 
 
 		 137 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3618  hypothetical protein  51.85 
 
 		 137 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.30176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12499  hypothetical protein  45.89 
 
 		 138 aa  120  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.113842 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1386  hypothetical protein  43.7 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.402075  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11790  predicted thioesterase  37.31 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.347124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1132  thioesterase superfamily protein  37.31 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  36.57 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  41.07 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1095  thioesterase superfamily protein  35.42 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  32.82 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3424  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996991  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08950  predicted thioesterase  31.08 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.936041  normal  0.0657601 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0934  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  32.56 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1355  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  33.57 
 
 		 130 aa  62  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  29.55 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3541  thioesterase superfamily protein  26.71 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3916  thioesterase superfamily protein  27.4 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.539762 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04420  predicted thioesterase  29.79 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17668  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  38.75 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0973  hypothetical protein  28.06 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0326933 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  32.67 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  32.35 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2639  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 166 aa  53.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0958965  normal  0.564769 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24680  predicted thioesterase  27.22 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.489708  normal  0.117336 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  31.48 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11530  predicted thioesterase  32 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  50 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1492  putative thioesterase  31.4 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299251  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  53.85 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  28.4 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 		 283 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  24.46 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  25.37 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  30.11 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  24.22 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  47.62 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  27.16 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  34.67 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  30.68 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 213 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0859  hypothetical protein  30.37 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1681  putative Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  30.71 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  0.0917493 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  24.64 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  38.1 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  51.35 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  33.73 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  62.07 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  62.07 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  23.91 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  26.24 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0349  hypothetical protein  27.14 
 
 		 147 aa  43.5  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0338  hypothetical protein  27.14 
 
 		 147 aa  43.5  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124802  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  36.36 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  30.21 
 
 		 149 aa  42.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  29.47 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  35.82 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  45.71 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  45.71 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  31.87 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  37.18 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  45.71 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  45.71 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  45.71 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  45.71 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  45.71 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 138 aa  42  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2936  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 131 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.535343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>