72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0349 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0349  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0338  hypothetical protein  99.32 
 
 
147 aa  299  6.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1883  hypothetical protein  61.36 
 
 
142 aa  178  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488202  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0454  hypothetical protein  59.7 
 
 
142 aa  174  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1456  esterase  47.73 
 
 
141 aa  127  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.711822  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3257  esterase  48.51 
 
 
142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.599162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1354  esterase  41.73 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1413  thioesterase superfamily protein  38.19 
 
 
145 aa  106  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364047  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3335  esterase  47.27 
 
 
118 aa  105  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3800  hypothetical protein  40 
 
 
141 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2100  thioesterase-like protein  36.3 
 
 
147 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118365  normal  0.0327511 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5117  hypothetical protein  38.06 
 
 
161 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357034  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2885  hypothetical protein  37.59 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2091  hypothetical protein  34.81 
 
 
147 aa  98.2  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2228  hypothetical protein  36.91 
 
 
151 aa  97.1  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00481735  hitchhiker  0.000000503639 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1601  esterase  32.35 
 
 
142 aa  86.7  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45600  hypothetical protein  41.23 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2881  putative thioesterase  45.59 
 
 
82 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.510611 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  25.78 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  27.07 
 
 
139 aa  62.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  26.17 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1492  putative thioesterase  25.37 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299251  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  26.02 
 
 
132 aa  47.4  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.31 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.31 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.31 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.31 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.31 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  26.67 
 
 
135 aa  46.2  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.06 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  22.56 
 
 
148 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  22.9 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.06 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  22.9 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  24.32 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  22.9 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  25.64 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  25.64 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  25.78 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  22.9 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  23.88 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25 
 
 
159 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  22.9 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
132 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  26.13 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  27.68 
 
 
139 aa  44.3  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4076  hypothetical protein  27.14 
 
 
144 aa  43.5  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
163 aa  43.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.56 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1054  thioesterase superfamily protein  24.03 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  22.73 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.72 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.37 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  22.9 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  22.4 
 
 
127 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  21.95 
 
 
133 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.48 
 
 
159 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0562  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  23.26 
 
 
150 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409991  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  23.85 
 
 
142 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  24.43 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.81 
 
 
128 aa  41.2  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  24.63 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.55 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.77 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.26 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 
156 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2889  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.76 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.992552  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  26.61 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.78 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>