34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1883 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1883  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  292  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488202  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0454  hypothetical protein  68.89 
 
 
142 aa  211  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0338  hypothetical protein  62.12 
 
 
147 aa  179  9.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0349  hypothetical protein  61.36 
 
 
147 aa  178  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1456  esterase  52.55 
 
 
141 aa  153  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.711822  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3257  esterase  53.33 
 
 
142 aa  153  8e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.599162  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3335  esterase  53.15 
 
 
118 aa  124  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3800  hypothetical protein  43.17 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1413  thioesterase superfamily protein  41.91 
 
 
145 aa  118  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364047  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2100  thioesterase-like protein  39.57 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118365  normal  0.0327511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2885  hypothetical protein  38.97 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1354  esterase  40.15 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5117  hypothetical protein  38.13 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357034  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2091  hypothetical protein  37.41 
 
 
147 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1601  esterase  34.27 
 
 
142 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45600  hypothetical protein  44.07 
 
 
131 aa  100  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2228  hypothetical protein  34.07 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00481735  hitchhiker  0.000000503639 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2881  putative thioesterase  56 
 
 
82 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.510611 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  29.46 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  21.31 
 
 
139 aa  47.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  21.09 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  20.63 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  22.79 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  21.36 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  22.79 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  22.73 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1215  acyl-ACP thioesterase, putative  25.37 
 
 
247 aa  42.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000117573  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  19.83 
 
 
141 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1492  putative thioesterase  27.35 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299251  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  22.06 
 
 
143 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  22.06 
 
 
143 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  22.06 
 
 
143 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>