35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_45600 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_45600  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  260  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2100  thioesterase-like protein  68.46 
 
 
147 aa  192  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118365  normal  0.0327511 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5117  hypothetical protein  64.84 
 
 
161 aa  178  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357034  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2885  hypothetical protein  63.08 
 
 
147 aa  176  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2091  hypothetical protein  62.5 
 
 
147 aa  175  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3800  hypothetical protein  60.48 
 
 
141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1456  esterase  51.61 
 
 
141 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.711822  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1883  hypothetical protein  44.07 
 
 
142 aa  100  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488202  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3257  esterase  41.94 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.599162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1354  esterase  39.84 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1601  esterase  38.89 
 
 
142 aa  90.1  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3335  esterase  42.74 
 
 
118 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0454  hypothetical protein  41.18 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1413  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364047  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0338  hypothetical protein  41.23 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0349  hypothetical protein  41.23 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2228  hypothetical protein  36.15 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00481735  hitchhiker  0.000000503639 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  30 
 
 
135 aa  55.1  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  31.93 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2881  putative thioesterase  42.47 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.510611 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1492  putative thioesterase  31.87 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299251  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1101  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151637  hitchhiker  0.00000232326 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1054  thioesterase superfamily protein  25.38 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  29.71 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  25.62 
 
 
153 aa  42  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  25.21 
 
 
143 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  25.21 
 
 
143 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  25.21 
 
 
143 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 
134 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  24.37 
 
 
142 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  25.62 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  25.42 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  25.42 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  22.69 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>