88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1978 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 153 aa  319  8e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  95.42 
 
 		 153 aa  306  5e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  86.81 
 
 		 153 aa  262  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  85.11 
 
 		 144 aa  254  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  83.69 
 
 		 144 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  83.69 
 
 		 144 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  82.98 
 
 		 144 aa  251  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  83.69 
 
 		 145 aa  243  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  81.56 
 
 		 149 aa  243  9e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  82.98 
 
 		 145 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  73.6 
 
 		 130 aa  189  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3390  thioesterase superfamily protein  53.24 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  47.59 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3245  thioesterase superfamily; K07107  50.36 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2806  hypothetical protein  46.45 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  48.15 
 
 		 164 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  44.6 
 
 		 156 aa  136  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 		 156 aa  133  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  43.28 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  40.88 
 
 		 158 aa  114  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  34.31 
 
 		 140 aa  103  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  38.93 
 
 		 145 aa  94  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  34.85 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  31.11 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  32.52 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  33.06 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0568  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.46 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  27.69 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  29.27 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.19 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 		 136 aa  57  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.8 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  28.8 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.23 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.93 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1107  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.08 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0129163  normal  0.667766 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.19 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 283 aa  48.1  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0478  thioesterase  21.49 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1689  thioesterase family protein  21.49 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  26.89 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  25.36 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4406  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.53 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0255254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1413  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364047  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  24.39 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3064  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0710  thioesterase superfamily protein  24.24 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.406632  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.17 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.57 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3301  thioesterase superfamily protein  24.44 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0091  hypothetical protein  26.89 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.107179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1450  hypothetical protein  28.57 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0723  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.28 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1533  hypothetical protein  28.57 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36680  acyl-coenzyme A thioester hydrolase  24.31 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  26.13 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  27.64 
 
 		 255 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0154  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0376255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  24.19 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0143  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.320461  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2516  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.780106  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 136 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2204  Acyl-ACP thioesterase  22.63 
 
 		 252 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.540769  normal  0.358344 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45600  hypothetical protein  25.62 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1013  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.55 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505536  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3505  hypothetical protein  27.94 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  42.42 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2718  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.401419  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 		 136 aa  40.8  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2752  hypothetical protein  25.38 
 
 		 133 aa  40.8  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.4 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  27.59 
 
 		 161 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  27.59 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>