58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3390 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3390  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 154 aa  326  7e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  55.56 
 
 		 145 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  54.86 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  59.4 
 
 		 140 aa  167  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  55.71 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  53.19 
 
 		 153 aa  158  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  49.31 
 
 		 144 aa  156  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 144 aa  156  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  49.31 
 
 		 144 aa  155  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  49.31 
 
 		 144 aa  155  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  53.24 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  53.24 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  53.17 
 
 		 130 aa  150  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3245  thioesterase superfamily; K07107  46.21 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  44.16 
 
 		 164 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 		 156 aa  140  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2806  hypothetical protein  42.86 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  37.58 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  38.36 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  29.5 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  35.43 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  31.67 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  32 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  30.08 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0568  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  28.23 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  29.27 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.67 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  29.27 
 
 		 255 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  28.93 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4078  Acyl-ACP thioesterase  26.98 
 
 		 246 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148044  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1413  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364047  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.15 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.61 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4202  acyl-ACP thioesterase  25.4 
 
 		 246 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4227  acyl-ACP thioesterase  25.4 
 
 		 246 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.85 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1054  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.77 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 134 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  25.89 
 
 		 283 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  24.79 
 
 		 135 aa  41.2  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.09 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  32.47 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3258  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.26455  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3168  acyl-ACP thioesterase  25.4 
 
 		 247 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.96192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2516  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 139 aa  40.4  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.780106  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1019  hypothetical protein  25.98 
 
 		 175 aa  40.4  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0102733  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>