63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01168 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  100 
 
 		 140 aa  297  4e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3390  thioesterase superfamily protein  59.4 
 
 		 154 aa  167  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  44.85 
 
 		 145 aa  137  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  44.12 
 
 		 145 aa  135  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  45.04 
 
 		 156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  42.45 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  44.03 
 
 		 153 aa  130  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  40.58 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  44.8 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  41.3 
 
 		 144 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 		 144 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 		 144 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  43.28 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  43.28 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2806  hypothetical protein  39.69 
 
 		 164 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3245  thioesterase superfamily; K07107  41.13 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  36.03 
 
 		 164 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 156 aa  92.8  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  34.81 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  33.59 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  30.43 
 
 		 163 aa  63.5  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.23 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  29.92 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3258  thioesterase superfamily protein  35.24 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.26455  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  31.97 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0529  thioesterase family protein  33.96 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.107465  normal  0.895725 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0494  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0496  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0557  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.159838 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00399  hypothetical protein  33.03 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0366  thioesterase family protein  33.03 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.356358  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3166  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118227  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0486  thioesterase family protein  33.03 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00849575  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00395  hypothetical protein  33.03 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0479  thioesterase family protein  33.03 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0624989  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0520  thioesterase family protein  33.03 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00162473  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3189  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590912  normal  0.0179744 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1054  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 		 136 aa  50.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1101  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151637  hitchhiker  0.00000232326 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3301  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0568  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1601  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0710  thioesterase superfamily protein  22.39 
 
 		 164 aa  42.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.406632  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3072  acyl-ACP thioesterase  20.74 
 
 		 253 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895181  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3086  thioesterase family protein  28.57 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112575  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  24.6 
 
 		 150 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3047  hypothetical protein  28.57 
 
 		 135 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3228  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  22.31 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3168  acyl-ACP thioesterase  22.73 
 
 		 247 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.96192e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>