49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3245 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3245  thioesterase superfamily; K07107  100 
 
 		 162 aa  332  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  88.16 
 
 		 164 aa  286  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2806  hypothetical protein  85.71 
 
 		 164 aa  282  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  74.31 
 
 		 158 aa  238  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  50.34 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  51.82 
 
 		 145 aa  154  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  51.09 
 
 		 145 aa  153  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  47.55 
 
 		 149 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 144 aa  151  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 144 aa  151  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 144 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  49.31 
 
 		 144 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3390  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  50.36 
 
 		 153 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  50.36 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  50.78 
 
 		 130 aa  134  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  42.18 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  41.13 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  40.41 
 
 		 158 aa  111  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  33.33 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  31.85 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  28.06 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  29.46 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.91 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  35.06 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  26.67 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  29.75 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 		 136 aa  50.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0568  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.83 
 
 		 134 aa  48.5  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.64 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  27.91 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  25.44 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  31.82 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  31.62 
 
 		 318 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3301  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 		 134 aa  42  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  25.64 
 
 		 136 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  24.6 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 		 132 aa  40.8  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  25.97 
 
 		 138 aa  40.4  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2090  hypothetical protein  24.22 
 
 		 133 aa  40.4  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000228869  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>