53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1428 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  100 
 
 		 318 aa  634    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1153  acyl-ACP thioesterase  32.93 
 
 		 243 aa  175  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4078  Acyl-ACP thioesterase  37.25 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4227  acyl-ACP thioesterase  36.47 
 
 		 246 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4202  acyl-ACP thioesterase  36.47 
 
 		 246 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2367  acyl-ACP thioesterase  36.9 
 
 		 254 aa  143  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.532089  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2204  Acyl-ACP thioesterase  32.67 
 
 		 252 aa  142  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.540769  normal  0.358344 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1334  Acyl-ACP thioesterase-like  39.44 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1732  Acyl-ACP thioesterase  35.91 
 
 		 247 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.127745 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2035  acyl-ACP thioesterase  36.65 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  34.35 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3072  acyl-ACP thioesterase  28.46 
 
 		 253 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895181  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3168  acyl-ACP thioesterase  30.47 
 
 		 247 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.96192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2253  acyl-ACP thioesterase  33.2 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29285  predicted protein  35.5 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6353  acyl-ACP thioesterase  27.95 
 
 		 247 aa  125  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3236  acyl-ACP thioesterase  32.16 
 
 		 255 aa  123  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2031  acyl-ACP thioesterase  37.23 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1725  acyl-ACP thioesterase  30.56 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.329649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0985  acyl-ACP thioesterase  31.4 
 
 		 241 aa  99.4  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253641  hitchhiker  0.00888512 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2461  acyl-ACP thioesterase  26.94 
 
 		 252 aa  94  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0635  acyl-ACP thioesterase  26.07 
 
 		 238 aa  92.8  7e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13580  acyl-ACP thioesterase  30.32 
 
 		 245 aa  91.7  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0202  acyl-ACP thioesterase  27.06 
 
 		 253 aa  90.9  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0283  Acyl-ACP thioesterase  24.32 
 
 		 243 aa  87.8  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3454  acyl-ACP thioesterase  27.91 
 
 		 248 aa  86.3  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604598  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0335  acyl-ACP thioesterase  28.1 
 
 		 253 aa  85.5  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2953  acyl-ACP thioesterase family protein  23.68 
 
 		 252 aa  82  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000476988  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2590  acyl-ACP thioesterase  29.83 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0251  acyl-ACP thioesterase  24.76 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000581314  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0377  Acyl-ACP thioesterase  27.37 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000890944  hitchhiker  0.000000869045 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2637  acyl-ACP thioesterase family protein  29.29 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000017914  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2954  acyl-ACP thioesterase family protein  28.57 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000617099  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0891  hypothetical protein  22.02 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.587244  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1253  Acyl-ACP thioesterase  21.81 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1215  acyl-ACP thioesterase, putative  22.04 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000117573  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2218  hypothetical protein  22.05 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  32.2 
 
 		 130 aa  53.5  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23720  acyl-ACP thioesterase  25.96 
 
 		 242 aa  53.5  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000256541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 145 aa  52.8  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1403  Acyl-ACP thioesterase  28.48 
 
 		 249 aa  50.4  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.100286  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  27.97 
 
 		 145 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  25 
 
 		 130 aa  48.5  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  28.26 
 
 		 145 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2369  acyl-ACP thioesterase  22.29 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.111453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  26.52 
 
 		 163 aa  46.6  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.43 
 
 		 130 aa  45.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  27.1 
 
 		 153 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 144 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10473  hypothetical protein  22.11 
 
 		 264 aa  43.5  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  28.92 
 
 		 155 aa  43.5  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 		 158 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>