97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_34330 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  100 
 
 
130 aa  267  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  75.61 
 
 
149 aa  192  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  70.31 
 
 
145 aa  190  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  75.2 
 
 
144 aa  189  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  75.2 
 
 
144 aa  189  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  73.6 
 
 
153 aa  189  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  73.6 
 
 
144 aa  188  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  68.75 
 
 
145 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  73.6 
 
 
144 aa  187  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  71.2 
 
 
153 aa  185  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  72 
 
 
153 aa  185  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3390  thioesterase superfamily protein  53.17 
 
 
154 aa  150  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  50.79 
 
 
158 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3245  thioesterase superfamily; K07107  50.78 
 
 
162 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  48.41 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  44.8 
 
 
140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2806  hypothetical protein  47.69 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  46.28 
 
 
156 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  45.08 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  37.19 
 
 
158 aa  95.1  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  40.94 
 
 
145 aa  90.9  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  33.9 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  39.67 
 
 
135 aa  84.3  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  33.87 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  36.21 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  37.7 
 
 
136 aa  77  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  35 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  36.84 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
154 aa  70.1  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.75 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 
136 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  26.23 
 
 
130 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0568  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0710  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.406632  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0635  acyl-ACP thioesterase  25.22 
 
 
238 aa  52  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
283 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  26.96 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3168  acyl-ACP thioesterase  25.83 
 
 
247 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.96192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  29.17 
 
 
255 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.73 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2255  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00034337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.73 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02688  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.56 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000607478  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3123  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.96 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  31.01 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.07 
 
 
137 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
139 aa  47.4  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3313  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.69 
 
 
139 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000159774  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  35.35 
 
 
137 aa  47  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3363  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.69 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1601  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.69 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000385666  hitchhiker  0.0000353735 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3617  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.69 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000115588 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3667  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.69 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 
155 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3714  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.69 
 
 
139 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3401  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.69 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818951  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  25.69 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3626  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  27.87 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00511508  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3632  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.87 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3064  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0478  thioesterase  24.19 
 
 
167 aa  43.9  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1689  thioesterase family protein  24.19 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.83 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0715  hypothetical protein  31.51 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.33 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3072  acyl-ACP thioesterase  26.17 
 
 
253 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895181  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  29.2 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3301  thioesterase superfamily protein  24.79 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3072  thioesterase-like protein  26.89 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1848  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149836  normal  0.418825 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  26.89 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2204  Acyl-ACP thioesterase  23.64 
 
 
252 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.540769  normal  0.358344 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4227  acyl-ACP thioesterase  26.15 
 
 
246 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3091  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  33.33 
 
 
134 aa  41.6  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 
143 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4078  Acyl-ACP thioesterase  25.58 
 
 
246 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148044  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 
149 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 
136 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4202  acyl-ACP thioesterase  26.15 
 
 
246 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.45 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.53 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1170  hypothetical protein  30.25 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456722  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4406  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.83 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0255254  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2735  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.96 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.234099  hitchhiker  0.000101572 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  22.22 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.79 
 
 
155 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  28.07 
 
 
155 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2632  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.8 
 
 
147 aa  40.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  27.83 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 
155 aa  40  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 
159 aa  40  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>