100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3064 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3064  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 136 aa  279  8.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  77.27 
 
 		 139 aa  212  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3301  thioesterase superfamily protein  74.44 
 
 		 134 aa  194  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  39.06 
 
 		 136 aa  86.7  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0710  thioesterase superfamily protein  38.02 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.406632  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  35.61 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  35.77 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  35.71 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  35.83 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  30.95 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3508  hypothetical protein  34.91 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.78 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.97 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  24.41 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2632  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1107  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.35 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0129163  normal  0.667766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0787  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267485  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0148  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.69 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  25.6 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  27.88 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00395  hypothetical protein  29.51 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0479  thioesterase family protein  29.51 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0624989  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00399  hypothetical protein  29.51 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3189  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590912  normal  0.0179744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0486  thioesterase family protein  29.51 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00849575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0520  thioesterase family protein  29.51 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00162473  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0529  thioesterase family protein  29.51 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.107465  normal  0.895725 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0366  thioesterase family protein  29.51 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.356358  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3166  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118227  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3500  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.076356 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.19 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  28.69 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3175  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.73 
 
 		 154 aa  47.4  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  27.87 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3205  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  27.34 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0969  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.56 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.475786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6801  thioesterase-like protein  24.22 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.16 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  29.37 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  23.68 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.37 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4057  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.7 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1450  hypothetical protein  30 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1533  hypothetical protein  30 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  26.83 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1090  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.61 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0496  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0494  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.159838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0557  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  28.07 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.81 
 
 		 285 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1214  thioesterase superfamily protein  27.18 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.859401  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 286 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  27.46 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  26.44 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3616  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  24.39 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47995  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0924  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.21 
 
 		 144 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0795864 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.32 
 
 		 134 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 140 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  26.12 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  47.22 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.41 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1849  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.35 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124156  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5232  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  24.39 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200026  normal  0.202993 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0571  putative thioesterase protein  26.98 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0749  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  23.31 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4765  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  23.58 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1596  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186946 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.05 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  27.1 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.5 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 		 287 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5307  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  22.73 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2953  acyl-ACP thioesterase family protein  28.28 
 
 		 252 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000476988  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.78 
 
 		 129 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>