97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1539 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  100 
 
 		 140 aa  294  3e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  36.57 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 		 144 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  35.04 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 		 153 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 		 144 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  33.58 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  33.58 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2806  hypothetical protein  36.23 
 
 		 164 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 149 aa  100  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3245  thioesterase superfamily; K07107  33.33 
 
 		 162 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 158 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3390  thioesterase superfamily protein  29.5 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  33.59 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  29.79 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  33.61 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  31.16 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  28.47 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  28.68 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  28.24 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  30.08 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3064  thioesterase superfamily protein  24.41 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51770  hypothetical protein  32.84 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185409 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  28.12 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  26.56 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3301  thioesterase superfamily protein  24.06 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4540  hypothetical protein  32.09 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36680  acyl-coenzyme A thioester hydrolase  29.77 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  25.38 
 
 		 130 aa  49.7  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1273  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.16 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0681  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.54 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0698  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.54 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4406  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.36 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0255254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.82 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0773  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.91 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.95 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  28.95 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  24.78 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.73 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4057  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.83 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0321  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.03 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0804  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.03 
 
 		 161 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  25.55 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0064  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.41 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0063  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.41 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.57846  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4200  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.56 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3997  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.41 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.666415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.2 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1247  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.19 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 142 aa  42.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.53 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  26.72 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1218  hypothetical protein  26.19 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3114  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144854  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  28.1 
 
 		 138 aa  42  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  31.58 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  24.26 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0091  hypothetical protein  29.82 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.107179  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0568  thioesterase superfamily protein  25.9 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.58 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  24.03 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3893  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.79 
 
 		 161 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.34 
 
 		 150 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.08 
 
 		 159 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  24.03 
 
 		 146 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  29.82 
 
 		 160 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.32 
 
 		 134 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  24.03 
 
 		 150 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  24.03 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  27.21 
 
 		 150 aa  41.2  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2936  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.535343  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0724  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.7 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.763036  normal  0.174534 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  23.08 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0710  thioesterase superfamily protein  23.66 
 
 		 164 aa  40.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.406632  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 131 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0154  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 		 132 aa  40  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0376255  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>