233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1133 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 135 aa  278  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  59.56 
 
 		 136 aa  161  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  46.43 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  39.67 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  36.89 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  36.89 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  38.17 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  38.17 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  34.85 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  36.51 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  34.85 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  33.33 
 
 		 153 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  32.06 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.23 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  25.81 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  29.77 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3072  acyl-ACP thioesterase  28.57 
 
 		 253 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000895181  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0710  thioesterase superfamily protein  35.38 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.406632  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2806  hypothetical protein  33.77 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1849  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.77 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124156  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  30.3 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3245  thioesterase superfamily; K07107  35.06 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3168  acyl-ACP thioesterase  25 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.96192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  40.62 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.53 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  29.77 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  32.47 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.75 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0066  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0003  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00198303  unclonable  0.00000000031845 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1273  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.77 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4363  thioesterase-like protein  33.73 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4340  thioesterase-like protein  33.73 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.408761  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  32.08 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3064  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4208  thioesterase-like  33.73 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0607121  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4406  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.77 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0255254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3301  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4200  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.53 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367475  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1218  hypothetical protein  28.79 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  34.45 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.45 
 
 		 285 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.33 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3390  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1247  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.79 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2204  Acyl-ACP thioesterase  29.25 
 
 		 252 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.540769  normal  0.358344 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51770  hypothetical protein  31.58 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0568  thioesterase superfamily protein  34.41 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.17 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.17 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00696  predicted acyl-CoA thioesterase  30.77 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000730216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2899  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.77 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252575  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0765  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.77 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133795  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0658  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.77 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013537  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0759  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.77 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000767242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2919  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.77 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000323269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00685  hypothetical protein  30.77 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00120853  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0789  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.77 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115548  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0839  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.77 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000201976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1444  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.084624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0902  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.53 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000167631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0871  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.53 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0203461  normal  0.184267 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0840  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.53 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  0.646292 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0715  hypothetical protein  23.76 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0780  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.53 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000472439  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 		 288 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3997  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.36 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.666415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0807  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.53 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000852325  normal  0.479233 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.29 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4540  hypothetical protein  30.83 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2020  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 		 176 aa  47.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36680  acyl-coenzyme A thioester hydrolase  31.25 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2088  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0701074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  29.03 
 
 		 138 aa  47.4  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  28.93 
 
 		 130 aa  47.4  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2372  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.47 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000888459  normal  0.224754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>