237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0568 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0568  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
143 aa  301  2.0000000000000002e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  41.32 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  38.33 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  31.2 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  30.4 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  32.17 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  36.22 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.54 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.5 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.6 
 
 
133 aa  62.8  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2484  hypothetical protein  29.46 
 
 
146 aa  62.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.838963  normal  0.0924158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  29.2 
 
 
155 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1013  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.54 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505536  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  34.65 
 
 
150 aa  61.6  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0472  thioesterase superfamily protein  34.4 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.563842  normal  0.634378 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.33 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0924  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0795864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4406  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.78 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0255254  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3175  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.28 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  32.23 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2718  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.2 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.401419  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3390  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51770  hypothetical protein  29.85 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185409 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.45 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0258  thioesterase  28.91 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024858  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3386  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36680  acyl-coenzyme A thioester hydrolase  29.1 
 
 
148 aa  57  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  30.95 
 
 
132 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.95 
 
 
132 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1273  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.55 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  32.76 
 
 
161 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  32.76 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3893  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.48 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  32.76 
 
 
161 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  32.76 
 
 
161 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  32.76 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  32.76 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  32.76 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  32.48 
 
 
160 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5307  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.62 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1703  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0741756  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4540  hypothetical protein  29.1 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1444  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 
129 aa  55.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.084624  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1107  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.52 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0129163  normal  0.667766 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0773  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.79 
 
 
161 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1215  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 
134 aa  53.9  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 
145 aa  53.9  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.75 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2632  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.68 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6904  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0171127  normal  0.306193 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0321  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.76 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0277  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.23 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0804  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.76 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0148  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.77 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3205  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.92 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473316  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4200  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.46 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367475  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.23 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0698  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.9 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0332  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.2 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0681  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.9 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.3 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3123  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.23 
 
 
143 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1090  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.33 
 
 
149 aa  51.6  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 
138 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0749  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  34.65 
 
 
150 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  29.41 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.83 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.4 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4057  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.51 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3997  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.79 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.666415  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1238  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.106775  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2464  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.77 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 
138 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.03 
 
 
135 aa  50.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  25.44 
 
 
158 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  26.83 
 
 
164 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  34.41 
 
 
135 aa  50.8  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0723  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.51 
 
 
150 aa  50.4  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2228  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.89 
 
 
140 aa  50.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.159905  hitchhiker  0.000289051 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1727  hypothetical protein  29.13 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1218  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339856  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2255  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 
139 aa  50.4  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00034337  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1247  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 
150 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 
128 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3500  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.13 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.076356 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0562  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.06 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409991  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2137  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  32.48 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3245  thioesterase superfamily; K07107  25.2 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>