74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1154 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 158 aa  326  8e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3245  thioesterase superfamily; K07107  74.31 
 
 		 162 aa  238  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  71.72 
 
 		 164 aa  229  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2806  hypothetical protein  71.72 
 
 		 164 aa  228  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  51.77 
 
 		 149 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  52.45 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  52.45 
 
 		 145 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  52.48 
 
 		 153 aa  160  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  50.7 
 
 		 144 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  50.7 
 
 		 144 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 144 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  50.7 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  50.35 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  47.59 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  45.39 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3390  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 		 154 aa  137  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  50.79 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  43.7 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  35.29 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  38.69 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  29.41 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  29.01 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  31.34 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  29.1 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  31.01 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  29.93 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  31.21 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  31.4 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0568  thioesterase superfamily protein  25.44 
 
 		 143 aa  50.8  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0710  thioesterase superfamily protein  27.01 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.406632  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  27.87 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  24.48 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  29.55 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  25.44 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.77 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0154  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0376255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 283 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 		 138 aa  44.7  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1703  thioesterase superfamily protein  24.44 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0741756  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 137 aa  43.9  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0158  thioesterase superfamily protein  22.86 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.27 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  26.85 
 
 		 318 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.02 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  26.55 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  25.42 
 
 		 128 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  26.77 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3301  thioesterase superfamily protein  23.31 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4859  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 		 134 aa  42  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  26.55 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  20 
 
 		 135 aa  41.6  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  22.73 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1132  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  24.82 
 
 		 142 aa  41.2  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0077  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.75 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  24.11 
 
 		 139 aa  40.8  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  25.2 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  24.62 
 
 		 150 aa  40.4  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>