56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1046 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
158 aa  330  6e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  42.75 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  43.48 
 
 
145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  43.48 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  41.78 
 
 
144 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  42.18 
 
 
153 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  40.41 
 
 
144 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  40.41 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  40.41 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  40.88 
 
 
153 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3390  thioesterase superfamily protein  38.36 
 
 
154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  40.88 
 
 
153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3245  thioesterase superfamily; K07107  40.41 
 
 
162 aa  111  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  39.42 
 
 
164 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  38.69 
 
 
158 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2806  hypothetical protein  39.04 
 
 
164 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  37.24 
 
 
156 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
156 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  37.19 
 
 
130 aa  95.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  34.81 
 
 
140 aa  86.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  28.47 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.58 
 
 
130 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  30 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  30.51 
 
 
129 aa  55.5  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  28.33 
 
 
130 aa  54.3  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 
129 aa  53.9  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
136 aa  51.2  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  27.74 
 
 
163 aa  50.4  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11790  predicted thioesterase  27.91 
 
 
146 aa  48.1  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.347124 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1101  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 
137 aa  47.4  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151637  hitchhiker  0.00000232326 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 
145 aa  47.4  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  26.81 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  26.83 
 
 
132 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3541  thioesterase superfamily protein  26.81 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564899  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
149 aa  44.3  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3916  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.539762 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  25.4 
 
 
283 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1054  thioesterase superfamily protein  27.83 
 
 
132 aa  42.4  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 
137 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3258  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 
132 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.26455  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3064  thioesterase superfamily protein  47.22 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 
134 aa  42  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1354  esterase  27.01 
 
 
143 aa  41.6  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1413  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364047  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3505  hypothetical protein  26.92 
 
 
133 aa  41.6  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  44.19 
 
 
135 aa  41.2  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0710  thioesterase superfamily protein  26.02 
 
 
164 aa  40.8  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.406632  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1780  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496186  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  31.08 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.27 
 
 
128 aa  40.4  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>