198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0505 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 136 aa  279  9e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  59.7 
 
 		 136 aa  183  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0710  thioesterase superfamily protein  41.09 
 
 		 164 aa  107  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.406632  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  37.8 
 
 		 130 aa  97.4  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  41.74 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  40.17 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  35.38 
 
 		 163 aa  88.2  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3064  thioesterase superfamily protein  39.06 
 
 		 136 aa  86.7  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  34.13 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3301  thioesterase superfamily protein  40.65 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  38.17 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  37.29 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  37.29 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3508  hypothetical protein  41.05 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.89619  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3390  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3245  thioesterase superfamily; K07107  29.46 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  28.68 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  32.85 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  33.06 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  29.93 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  36 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3505  hypothetical protein  32.8 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.66 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2806  hypothetical protein  27.91 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  25.93 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  28.57 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2516  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.780106  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0338  hypothetical protein  30.33 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124802  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1852  thioesterase  31.11 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304931  normal  0.230458 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0154  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0376255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0349  hypothetical protein  30.33 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0091  hypothetical protein  29.91 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.107179  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0104  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0454736  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0934  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 		 283 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.45 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.45 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.45 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  28.57 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  29.69 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  30.15 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0158  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  23.26 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0143  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.320461  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  25 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.45 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  27.83 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  23.66 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.52 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  23.76 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4859  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  25.62 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.62 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.62 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  25.62 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1366  thioesterase superfamily protein  35.53 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.974133 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.62 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.66 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>