140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1366 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1366  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
130 aa  269  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.974133 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3505  hypothetical protein  58.25 
 
 
133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  51.2 
 
 
138 aa  124  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0158  thioesterase superfamily protein  51.16 
 
 
141 aa  124  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1075  thioesterase superfamily protein  46.27 
 
 
134 aa  123  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0091  hypothetical protein  57.14 
 
 
135 aa  122  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.107179  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0104  thioesterase superfamily protein  53.27 
 
 
142 aa  122  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0454736  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0154  thioesterase superfamily protein  52.71 
 
 
132 aa  120  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0376255  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1543  thioesterase family protein  47.24 
 
 
139 aa  120  8e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  50.85 
 
 
128 aa  118  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2516  thioesterase superfamily protein  48.41 
 
 
139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.780106  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0143  thioesterase superfamily protein  48.41 
 
 
138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.320461  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2201  thioesterase superfamily protein  47.66 
 
 
132 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0478  thioesterase  33.33 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1689  thioesterase family protein  33.33 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4077  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0701  hypothetical protein  29.84 
 
 
153 aa  60.5  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00299166  normal  0.252492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1780  thioesterase superfamily protein  39.73 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496186  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2632  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  34.26 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3205  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.05 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473316  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4356  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.509436 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  36.71 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
134 aa  51.6  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0557  thioesterase superfamily protein  28.42 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.977538  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3500  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.2 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.076356 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1106  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 
135 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.157487 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  33.78 
 
 
138 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0494  thioesterase superfamily protein  32.04 
 
 
132 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0729  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.62 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.159838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0557  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638936  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0496  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0787  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.77 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267485  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0641  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00395  hypothetical protein  35.62 
 
 
132 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3166  thioesterase superfamily protein  35.62 
 
 
132 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118227  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00399  hypothetical protein  35.62 
 
 
132 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0520  thioesterase family protein  35.62 
 
 
132 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00162473  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0479  thioesterase family protein  35.62 
 
 
132 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0624989  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3189  thioesterase superfamily protein  35.62 
 
 
132 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590912  normal  0.0179744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0486  thioesterase family protein  35.62 
 
 
132 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00849575  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0366  thioesterase family protein  35.62 
 
 
132 aa  47  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.356358  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  28 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3609  hypothetical protein  28.18 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.68702  hitchhiker  0.000160663 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  32.1 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.18 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  35.53 
 
 
136 aa  46.2  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0529  thioesterase family protein  35.62 
 
 
132 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.107465  normal  0.895725 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.58 
 
 
145 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0474  hypothetical protein  25 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.637818  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 
147 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  31.94 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1101  thioesterase superfamily protein  33.75 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151637  hitchhiker  0.00000232326 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  33.33 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1444  thioesterase superfamily protein  31.76 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.084624  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.2 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07490  predicted thioesterase  34.57 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.736623 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0969  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.56 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.475786  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1179  thioesterase superfamily protein  33.78 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1170  hypothetical protein  30.33 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456722  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1703  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0741756  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0063  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.52 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.57846  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1149  thioesterase superfamily protein  33.78 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0064  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.52 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246744  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1390  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.7 
 
 
132 aa  44.7  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00302966  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1596  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 
149 aa  44.3  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186946 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  26.42 
 
 
128 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1979  thioesterase superfamily protein  27.71 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105854  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  28.16 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.3 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1849  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.91 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124156  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  37.7 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  26.73 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2444  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.93 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000193862  normal  0.240329 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2535  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.93 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000842763  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.3 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0643  hypothetical protein  32.1 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  27.63 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2752  hypothetical protein  30.93 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  27.18 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.53 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2372  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.9 
 
 
133 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000888459  normal  0.224754 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03885  hypothetical protein  24.14 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  31.11 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3616  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.53 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47995  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.11 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1603  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.9 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000704517  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0749  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.36 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 
143 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3086  thioesterase family protein  32.1 
 
 
135 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112575  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  28.87 
 
 
146 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3047  hypothetical protein  32.1 
 
 
135 aa  41.6  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 
144 aa  41.6  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>